Protein–RNA interactions for Protein: Q86TD4

SRL, Sarcalumenin, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRLQ86TD4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SRLQ86TD4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRLQ86TD4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRLQ86TD4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRLQ86TD4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRLQ86TD4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRLQ86TD4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRLQ86TD4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRLQ86TD4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRLQ86TD4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SRLQ86TD4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRLQ86TD4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRLQ86TD4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRLQ86TD4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRLQ86TD4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRLQ86TD4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRLQ86TD4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRLQ86TD4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRLQ86TD4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRLQ86TD4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SRLQ86TD4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRLQ86TD4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRLQ86TD4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRLQ86TD4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRLQ86TD4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRLQ86TD4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRLQ86TD4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRLQ86TD4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRLQ86TD4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRLQ86TD4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRLQ86TD4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRLQ86TD4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRLQ86TD4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRLQ86TD4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRLQ86TD4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRLQ86TD4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRLQ86TD4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRLQ86TD4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRLQ86TD4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRLQ86TD4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRLQ86TD4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRLQ86TD4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRLQ86TD4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRLQ86TD4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRLQ86TD4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRLQ86TD4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SRLQ86TD4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRLQ86TD4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRLQ86TD4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRLQ86TD4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SRLQ86TD4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SRLQ86TD4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRLQ86TD4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRLQ86TD4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRLQ86TD4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRLQ86TD4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRLQ86TD4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRLQ86TD4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRLQ86TD4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRLQ86TD4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SRLQ86TD4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRLQ86TD4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRLQ86TD4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRLQ86TD4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRLQ86TD4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRLQ86TD4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRLQ86TD4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRLQ86TD4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRLQ86TD4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRLQ86TD4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRLQ86TD4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SRLQ86TD4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SRLQ86TD4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SRLQ86TD4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SRLQ86TD4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SRLQ86TD4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SRLQ86TD4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SRLQ86TD4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SRLQ86TD4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SRLQ86TD4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRLQ86TD4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRLQ86TD4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRLQ86TD4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRLQ86TD4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRLQ86TD4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRLQ86TD4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRLQ86TD4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRLQ86TD4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRLQ86TD4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRLQ86TD4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRLQ86TD4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRLQ86TD4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRLQ86TD4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRLQ86TD4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRLQ86TD4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRLQ86TD4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRLQ86TD4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRLQ86TD4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRLQ86TD4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRLQ86TD4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms