Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc50Q810U5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc50Q810U5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc50Q810U5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc50Q810U5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc50Q810U5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc50Q810U5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc50Q810U5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc50Q810U5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc50Q810U5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc50Q810U5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc50Q810U5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc50Q810U5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc50Q810U5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc50Q810U5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc50Q810U5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc50Q810U5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc50Q810U5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc50Q810U5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc50Q810U5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc50Q810U5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc50Q810U5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc50Q810U5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc50Q810U5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc50Q810U5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc50Q810U5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc50Q810U5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc50Q810U5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc50Q810U5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc50Q810U5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc50Q810U5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc50Q810U5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc50Q810U5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc50Q810U5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc50Q810U5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc50Q810U5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc50Q810U5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc50Q810U5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc50Q810U5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc50Q810U5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc50Q810U5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc50Q810U5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc50Q810U5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc50Q810U5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc50Q810U5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc50Q810U5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc50Q810U5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc50Q810U5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc50Q810U5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc50Q810U5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc50Q810U5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc50Q810U5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc50Q810U5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc50Q810U5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc50Q810U5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc50Q810U5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc50Q810U5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc50Q810U5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc50Q810U5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc50Q810U5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc50Q810U5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc50Q810U5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc50Q810U5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc50Q810U5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc50Q810U5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc50Q810U5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc50Q810U5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc50Q810U5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc50Q810U5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc50Q810U5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc50Q810U5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc50Q810U5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc50Q810U5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc50Q810U5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc50Q810U5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc50Q810U5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc50Q810U5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc50Q810U5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc50Q810U5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc50Q810U5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc50Q810U5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc50Q810U5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc50Q810U5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc50Q810U5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc50Q810U5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc50Q810U5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc50Q810U5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc50Q810U5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc50Q810U5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc50Q810U5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc50Q810U5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc50Q810U5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc50Q810U5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc50Q810U5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc50Q810U5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc50Q810U5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc50Q810U5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc50Q810U5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc50Q810U5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc50Q810U5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms