Protein–RNA interactions for Protein: Q80YV2

Zc3hc1, Nuclear-interacting partner of ALK, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3hc1Q80YV2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zc3hc1Q80YV2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zc3hc1Q80YV2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zc3hc1Q80YV2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zc3hc1Q80YV2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zc3hc1Q80YV2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zc3hc1Q80YV2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zc3hc1Q80YV2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zc3hc1Q80YV2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zc3hc1Q80YV2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zc3hc1Q80YV2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zc3hc1Q80YV2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zc3hc1Q80YV2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zc3hc1Q80YV2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zc3hc1Q80YV2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zc3hc1Q80YV2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zc3hc1Q80YV2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zc3hc1Q80YV2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zc3hc1Q80YV2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zc3hc1Q80YV2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zc3hc1Q80YV2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zc3hc1Q80YV2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Zc3hc1Q80YV2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Zc3hc1Q80YV2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zc3hc1Q80YV2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zc3hc1Q80YV2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zc3hc1Q80YV2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zc3hc1Q80YV2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Zc3hc1Q80YV2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zc3hc1Q80YV2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zc3hc1Q80YV2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zc3hc1Q80YV2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zc3hc1Q80YV2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zc3hc1Q80YV2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zc3hc1Q80YV2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zc3hc1Q80YV2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zc3hc1Q80YV2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zc3hc1Q80YV2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zc3hc1Q80YV2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zc3hc1Q80YV2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zc3hc1Q80YV2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zc3hc1Q80YV2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zc3hc1Q80YV2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zc3hc1Q80YV2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Zc3hc1Q80YV2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zc3hc1Q80YV2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zc3hc1Q80YV2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zc3hc1Q80YV2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zc3hc1Q80YV2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zc3hc1Q80YV2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3hc1Q80YV2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3hc1Q80YV2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zc3hc1Q80YV2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3hc1Q80YV2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3hc1Q80YV2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3hc1Q80YV2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3hc1Q80YV2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3hc1Q80YV2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3hc1Q80YV2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3hc1Q80YV2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3hc1Q80YV2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3hc1Q80YV2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zc3hc1Q80YV2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zc3hc1Q80YV2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3hc1Q80YV2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3hc1Q80YV2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3hc1Q80YV2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zc3hc1Q80YV2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zc3hc1Q80YV2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zc3hc1Q80YV2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3hc1Q80YV2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zc3hc1Q80YV2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3hc1Q80YV2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zc3hc1Q80YV2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zc3hc1Q80YV2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zc3hc1Q80YV2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3hc1Q80YV2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3hc1Q80YV2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3hc1Q80YV2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3hc1Q80YV2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3hc1Q80YV2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3hc1Q80YV2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3hc1Q80YV2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3hc1Q80YV2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3hc1Q80YV2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3hc1Q80YV2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3hc1Q80YV2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3hc1Q80YV2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3hc1Q80YV2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3hc1Q80YV2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zc3hc1Q80YV2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zc3hc1Q80YV2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zc3hc1Q80YV2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zc3hc1Q80YV2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zc3hc1Q80YV2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zc3hc1Q80YV2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zc3hc1Q80YV2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zc3hc1Q80YV2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3hc1Q80YV2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3hc1Q80YV2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms