Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nrde2Q80XC6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nrde2Q80XC6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nrde2Q80XC6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nrde2Q80XC6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nrde2Q80XC6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Nrde2Q80XC6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nrde2Q80XC6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nrde2Q80XC6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nrde2Q80XC6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nrde2Q80XC6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nrde2Q80XC6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nrde2Q80XC6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nrde2Q80XC6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nrde2Q80XC6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nrde2Q80XC6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nrde2Q80XC6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nrde2Q80XC6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Nrde2Q80XC6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nrde2Q80XC6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nrde2Q80XC6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Nrde2Q80XC6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nrde2Q80XC6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nrde2Q80XC6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Nrde2Q80XC6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nrde2Q80XC6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nrde2Q80XC6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nrde2Q80XC6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nrde2Q80XC6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nrde2Q80XC6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nrde2Q80XC6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nrde2Q80XC6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nrde2Q80XC6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nrde2Q80XC6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Nrde2Q80XC6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nrde2Q80XC6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nrde2Q80XC6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nrde2Q80XC6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nrde2Q80XC6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nrde2Q80XC6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Nrde2Q80XC6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nrde2Q80XC6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nrde2Q80XC6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Nrde2Q80XC6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nrde2Q80XC6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nrde2Q80XC6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nrde2Q80XC6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nrde2Q80XC6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nrde2Q80XC6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nrde2Q80XC6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nrde2Q80XC6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nrde2Q80XC6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nrde2Q80XC6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nrde2Q80XC6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nrde2Q80XC6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nrde2Q80XC6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nrde2Q80XC6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nrde2Q80XC6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nrde2Q80XC6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nrde2Q80XC6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nrde2Q80XC6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nrde2Q80XC6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nrde2Q80XC6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nrde2Q80XC6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nrde2Q80XC6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Nrde2Q80XC6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nrde2Q80XC6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nrde2Q80XC6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nrde2Q80XC6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nrde2Q80XC6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nrde2Q80XC6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nrde2Q80XC6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nrde2Q80XC6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nrde2Q80XC6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nrde2Q80XC6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nrde2Q80XC6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nrde2Q80XC6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nrde2Q80XC6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nrde2Q80XC6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nrde2Q80XC6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nrde2Q80XC6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nrde2Q80XC6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Nrde2Q80XC6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nrde2Q80XC6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Nrde2Q80XC6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nrde2Q80XC6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nrde2Q80XC6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nrde2Q80XC6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nrde2Q80XC6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nrde2Q80XC6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nrde2Q80XC6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nrde2Q80XC6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nrde2Q80XC6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nrde2Q80XC6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nrde2Q80XC6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nrde2Q80XC6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nrde2Q80XC6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nrde2Q80XC6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nrde2Q80XC6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nrde2Q80XC6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms