Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp8Q80U87 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp8Q80U87 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp8Q80U87 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp8Q80U87 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp8Q80U87 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp8Q80U87 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp8Q80U87 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp8Q80U87 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp8Q80U87 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp8Q80U87 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp8Q80U87 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp8Q80U87 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Usp8Q80U87 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp8Q80U87 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp8Q80U87 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp8Q80U87 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp8Q80U87 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp8Q80U87 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp8Q80U87 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp8Q80U87 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp8Q80U87 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp8Q80U87 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp8Q80U87 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp8Q80U87 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp8Q80U87 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp8Q80U87 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp8Q80U87 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp8Q80U87 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp8Q80U87 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp8Q80U87 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp8Q80U87 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp8Q80U87 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp8Q80U87 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp8Q80U87 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp8Q80U87 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp8Q80U87 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp8Q80U87 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp8Q80U87 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp8Q80U87 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp8Q80U87 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp8Q80U87 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp8Q80U87 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp8Q80U87 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp8Q80U87 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp8Q80U87 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp8Q80U87 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp8Q80U87 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp8Q80U87 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp8Q80U87 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp8Q80U87 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp8Q80U87 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp8Q80U87 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp8Q80U87 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp8Q80U87 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp8Q80U87 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp8Q80U87 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp8Q80U87 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp8Q80U87 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp8Q80U87 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp8Q80U87 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp8Q80U87 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp8Q80U87 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp8Q80U87 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp8Q80U87 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp8Q80U87 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp8Q80U87 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp8Q80U87 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp8Q80U87 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp8Q80U87 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp8Q80U87 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp8Q80U87 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp8Q80U87 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp8Q80U87 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp8Q80U87 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp8Q80U87 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp8Q80U87 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp8Q80U87 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp8Q80U87 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp8Q80U87 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp8Q80U87 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp8Q80U87 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp8Q80U87 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp8Q80U87 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp8Q80U87 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp8Q80U87 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp8Q80U87 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp8Q80U87 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp8Q80U87 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp8Q80U87 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp8Q80U87 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp8Q80U87 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp8Q80U87 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp8Q80U87 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp8Q80U87 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp8Q80U87 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp8Q80U87 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp8Q80U87 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp8Q80U87 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp8Q80U87 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms