Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5L3

C1QL2, Complement C1q-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL2Q7Z5L3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1QL2Q7Z5L3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1QL2Q7Z5L3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1QL2Q7Z5L3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1QL2Q7Z5L3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1QL2Q7Z5L3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1QL2Q7Z5L3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1QL2Q7Z5L3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1QL2Q7Z5L3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1QL2Q7Z5L3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1QL2Q7Z5L3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1QL2Q7Z5L3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1QL2Q7Z5L3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1QL2Q7Z5L3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1QL2Q7Z5L3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QL2Q7Z5L3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QL2Q7Z5L3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QL2Q7Z5L3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QL2Q7Z5L3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QL2Q7Z5L3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1QL2Q7Z5L3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QL2Q7Z5L3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QL2Q7Z5L3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QL2Q7Z5L3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QL2Q7Z5L3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QL2Q7Z5L3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1QL2Q7Z5L3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1QL2Q7Z5L3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1QL2Q7Z5L3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1QL2Q7Z5L3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1QL2Q7Z5L3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1QL2Q7Z5L3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C1QL2Q7Z5L3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
C1QL2Q7Z5L3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1QL2Q7Z5L3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1QL2Q7Z5L3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QL2Q7Z5L3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QL2Q7Z5L3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QL2Q7Z5L3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QL2Q7Z5L3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QL2Q7Z5L3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QL2Q7Z5L3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QL2Q7Z5L3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QL2Q7Z5L3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QL2Q7Z5L3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QL2Q7Z5L3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QL2Q7Z5L3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QL2Q7Z5L3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1QL2Q7Z5L3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1QL2Q7Z5L3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1QL2Q7Z5L3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1QL2Q7Z5L3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1QL2Q7Z5L3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1QL2Q7Z5L3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1QL2Q7Z5L3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1QL2Q7Z5L3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1QL2Q7Z5L3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C1QL2Q7Z5L3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C1QL2Q7Z5L3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C1QL2Q7Z5L3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C1QL2Q7Z5L3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1QL2Q7Z5L3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1QL2Q7Z5L3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1QL2Q7Z5L3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1QL2Q7Z5L3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1QL2Q7Z5L3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1QL2Q7Z5L3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1QL2Q7Z5L3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1QL2Q7Z5L3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C1QL2Q7Z5L3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1QL2Q7Z5L3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QL2Q7Z5L3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QL2Q7Z5L3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QL2Q7Z5L3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QL2Q7Z5L3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QL2Q7Z5L3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QL2Q7Z5L3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QL2Q7Z5L3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QL2Q7Z5L3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QL2Q7Z5L3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QL2Q7Z5L3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QL2Q7Z5L3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QL2Q7Z5L3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QL2Q7Z5L3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QL2Q7Z5L3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QL2Q7Z5L3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QL2Q7Z5L3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QL2Q7Z5L3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QL2Q7Z5L3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QL2Q7Z5L3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QL2Q7Z5L3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QL2Q7Z5L3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QL2Q7Z5L3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QL2Q7Z5L3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QL2Q7Z5L3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QL2Q7Z5L3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QL2Q7Z5L3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QL2Q7Z5L3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QL2Q7Z5L3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QL2Q7Z5L3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms