Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
UBE3BQ7Z3V4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.63■■■□□ 2.97
UBE3BQ7Z3V4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
UBE3BQ7Z3V4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
UBE3BQ7Z3V4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
UBE3BQ7Z3V4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
UBE3BQ7Z3V4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
UBE3BQ7Z3V4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
UBE3BQ7Z3V4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
UBE3BQ7Z3V4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
UBE3BQ7Z3V4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
UBE3BQ7Z3V4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
UBE3BQ7Z3V4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
UBE3BQ7Z3V4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
UBE3BQ7Z3V4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
UBE3BQ7Z3V4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.55■■■□□ 2.96
UBE3BQ7Z3V4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
UBE3BQ7Z3V4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
UBE3BQ7Z3V4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
UBE3BQ7Z3V4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
UBE3BQ7Z3V4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
UBE3BQ7Z3V4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
UBE3BQ7Z3V4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
UBE3BQ7Z3V4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
UBE3BQ7Z3V4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
UBE3BQ7Z3V4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
UBE3BQ7Z3V4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
UBE3BQ7Z3V4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
UBE3BQ7Z3V4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
UBE3BQ7Z3V4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
UBE3BQ7Z3V4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
UBE3BQ7Z3V4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
UBE3BQ7Z3V4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
UBE3BQ7Z3V4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
UBE3BQ7Z3V4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
UBE3BQ7Z3V4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
UBE3BQ7Z3V4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
UBE3BQ7Z3V4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
UBE3BQ7Z3V4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
UBE3BQ7Z3V4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
UBE3BQ7Z3V4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
UBE3BQ7Z3V4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
UBE3BQ7Z3V4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
UBE3BQ7Z3V4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
UBE3BQ7Z3V4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
UBE3BQ7Z3V4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
UBE3BQ7Z3V4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
UBE3BQ7Z3V4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
UBE3BQ7Z3V4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
UBE3BQ7Z3V4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
UBE3BQ7Z3V4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
UBE3BQ7Z3V4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
UBE3BQ7Z3V4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
UBE3BQ7Z3V4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
UBE3BQ7Z3V4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
UBE3BQ7Z3V4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
UBE3BQ7Z3V4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
UBE3BQ7Z3V4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
UBE3BQ7Z3V4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
UBE3BQ7Z3V4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
UBE3BQ7Z3V4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
UBE3BQ7Z3V4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
UBE3BQ7Z3V4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
UBE3BQ7Z3V4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
UBE3BQ7Z3V4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
UBE3BQ7Z3V4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
UBE3BQ7Z3V4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
UBE3BQ7Z3V4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
UBE3BQ7Z3V4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
UBE3BQ7Z3V4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
UBE3BQ7Z3V4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
UBE3BQ7Z3V4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
UBE3BQ7Z3V4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
UBE3BQ7Z3V4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
UBE3BQ7Z3V4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
UBE3BQ7Z3V4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
UBE3BQ7Z3V4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
UBE3BQ7Z3V4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
UBE3BQ7Z3V4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
UBE3BQ7Z3V4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
UBE3BQ7Z3V4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
UBE3BQ7Z3V4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
UBE3BQ7Z3V4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
UBE3BQ7Z3V4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
UBE3BQ7Z3V4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
UBE3BQ7Z3V4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
UBE3BQ7Z3V4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
UBE3BQ7Z3V4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
UBE3BQ7Z3V4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
UBE3BQ7Z3V4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
UBE3BQ7Z3V4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
UBE3BQ7Z3V4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.25■■■□□ 2.91
UBE3BQ7Z3V4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
UBE3BQ7Z3V4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
UBE3BQ7Z3V4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
UBE3BQ7Z3V4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
UBE3BQ7Z3V4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
UBE3BQ7Z3V4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
UBE3BQ7Z3V4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
UBE3BQ7Z3V4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms