Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf18Q7TS55 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf18Q7TS55 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf18Q7TS55 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf18Q7TS55 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf18Q7TS55 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf18Q7TS55 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf18Q7TS55 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf18Q7TS55 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf18Q7TS55 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf18Q7TS55 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf18Q7TS55 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf18Q7TS55 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf18Q7TS55 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf18Q7TS55 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf18Q7TS55 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf18Q7TS55 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf18Q7TS55 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf18Q7TS55 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf18Q7TS55 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf18Q7TS55 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf18Q7TS55 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf18Q7TS55 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf18Q7TS55 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf18Q7TS55 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf18Q7TS55 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf18Q7TS55 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf18Q7TS55 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf18Q7TS55 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf18Q7TS55 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf18Q7TS55 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf18Q7TS55 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf18Q7TS55 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf18Q7TS55 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf18Q7TS55 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf18Q7TS55 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf18Q7TS55 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf18Q7TS55 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf18Q7TS55 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfsf18Q7TS55 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf18Q7TS55 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf18Q7TS55 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf18Q7TS55 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf18Q7TS55 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf18Q7TS55 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf18Q7TS55 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf18Q7TS55 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf18Q7TS55 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnfsf18Q7TS55 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnfsf18Q7TS55 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfsf18Q7TS55 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfsf18Q7TS55 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfsf18Q7TS55 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf18Q7TS55 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf18Q7TS55 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf18Q7TS55 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf18Q7TS55 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf18Q7TS55 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf18Q7TS55 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf18Q7TS55 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf18Q7TS55 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf18Q7TS55 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf18Q7TS55 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf18Q7TS55 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnfsf18Q7TS55 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf18Q7TS55 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf18Q7TS55 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf18Q7TS55 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf18Q7TS55 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf18Q7TS55 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf18Q7TS55 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf18Q7TS55 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf18Q7TS55 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf18Q7TS55 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf18Q7TS55 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf18Q7TS55 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf18Q7TS55 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf18Q7TS55 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf18Q7TS55 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf18Q7TS55 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf18Q7TS55 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf18Q7TS55 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf18Q7TS55 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf18Q7TS55 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf18Q7TS55 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf18Q7TS55 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf18Q7TS55 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf18Q7TS55 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf18Q7TS55 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf18Q7TS55 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf18Q7TS55 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf18Q7TS55 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf18Q7TS55 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf18Q7TS55 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf18Q7TS55 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf18Q7TS55 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf18Q7TS55 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf18Q7TS55 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf18Q7TS55 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf18Q7TS55 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms