Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn4bQ7M729 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn4bQ7M729 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn4bQ7M729 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scn4bQ7M729 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scn4bQ7M729 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scn4bQ7M729 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scn4bQ7M729 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scn4bQ7M729 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn4bQ7M729 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scn4bQ7M729 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Scn4bQ7M729 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scn4bQ7M729 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scn4bQ7M729 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn4bQ7M729 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn4bQ7M729 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn4bQ7M729 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn4bQ7M729 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn4bQ7M729 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn4bQ7M729 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn4bQ7M729 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn4bQ7M729 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn4bQ7M729 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scn4bQ7M729 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scn4bQ7M729 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scn4bQ7M729 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scn4bQ7M729 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn4bQ7M729 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn4bQ7M729 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scn4bQ7M729 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scn4bQ7M729 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scn4bQ7M729 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scn4bQ7M729 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn4bQ7M729 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn4bQ7M729 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Scn4bQ7M729 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scn4bQ7M729 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scn4bQ7M729 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Scn4bQ7M729 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scn4bQ7M729 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scn4bQ7M729 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn4bQ7M729 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn4bQ7M729 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn4bQ7M729 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scn4bQ7M729 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scn4bQ7M729 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scn4bQ7M729 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scn4bQ7M729 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scn4bQ7M729 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn4bQ7M729 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Scn4bQ7M729 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Scn4bQ7M729 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scn4bQ7M729 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn4bQ7M729 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn4bQ7M729 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn4bQ7M729 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn4bQ7M729 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn4bQ7M729 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scn4bQ7M729 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scn4bQ7M729 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scn4bQ7M729 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn4bQ7M729 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn4bQ7M729 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn4bQ7M729 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Scn4bQ7M729 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scn4bQ7M729 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scn4bQ7M729 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scn4bQ7M729 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scn4bQ7M729 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scn4bQ7M729 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scn4bQ7M729 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scn4bQ7M729 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scn4bQ7M729 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scn4bQ7M729 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scn4bQ7M729 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scn4bQ7M729 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scn4bQ7M729 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Scn4bQ7M729 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scn4bQ7M729 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scn4bQ7M729 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scn4bQ7M729 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scn4bQ7M729 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scn4bQ7M729 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scn4bQ7M729 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scn4bQ7M729 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scn4bQ7M729 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scn4bQ7M729 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scn4bQ7M729 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scn4bQ7M729 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scn4bQ7M729 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scn4bQ7M729 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scn4bQ7M729 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scn4bQ7M729 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scn4bQ7M729 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scn4bQ7M729 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scn4bQ7M729 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scn4bQ7M729 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scn4bQ7M729 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scn4bQ7M729 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scn4bQ7M729 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms