Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMUB2Q71RG4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMUB2Q71RG4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMUB2Q71RG4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMUB2Q71RG4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMUB2Q71RG4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMUB2Q71RG4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMUB2Q71RG4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMUB2Q71RG4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMUB2Q71RG4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMUB2Q71RG4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMUB2Q71RG4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMUB2Q71RG4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMUB2Q71RG4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMUB2Q71RG4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMUB2Q71RG4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMUB2Q71RG4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMUB2Q71RG4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMUB2Q71RG4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMUB2Q71RG4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMUB2Q71RG4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMUB2Q71RG4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMUB2Q71RG4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMUB2Q71RG4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMUB2Q71RG4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMUB2Q71RG4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMUB2Q71RG4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMUB2Q71RG4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMUB2Q71RG4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMUB2Q71RG4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMUB2Q71RG4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMUB2Q71RG4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMUB2Q71RG4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMUB2Q71RG4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMUB2Q71RG4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMUB2Q71RG4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMUB2Q71RG4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMUB2Q71RG4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMUB2Q71RG4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMUB2Q71RG4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMUB2Q71RG4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMUB2Q71RG4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMUB2Q71RG4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMUB2Q71RG4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMUB2Q71RG4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMUB2Q71RG4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMUB2Q71RG4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMUB2Q71RG4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMUB2Q71RG4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMUB2Q71RG4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMUB2Q71RG4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMUB2Q71RG4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMUB2Q71RG4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMUB2Q71RG4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMUB2Q71RG4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMUB2Q71RG4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMUB2Q71RG4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMUB2Q71RG4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMUB2Q71RG4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMUB2Q71RG4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMUB2Q71RG4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMUB2Q71RG4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMUB2Q71RG4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMUB2Q71RG4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMUB2Q71RG4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMUB2Q71RG4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMUB2Q71RG4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMUB2Q71RG4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMUB2Q71RG4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMUB2Q71RG4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMUB2Q71RG4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMUB2Q71RG4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMUB2Q71RG4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMUB2Q71RG4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMUB2Q71RG4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMUB2Q71RG4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMUB2Q71RG4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMUB2Q71RG4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMUB2Q71RG4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMUB2Q71RG4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMUB2Q71RG4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMUB2Q71RG4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMUB2Q71RG4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMUB2Q71RG4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMUB2Q71RG4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMUB2Q71RG4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMUB2Q71RG4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMUB2Q71RG4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMUB2Q71RG4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMUB2Q71RG4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMUB2Q71RG4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMUB2Q71RG4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMUB2Q71RG4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMUB2Q71RG4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMUB2Q71RG4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMUB2Q71RG4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMUB2Q71RG4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMUB2Q71RG4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMUB2Q71RG4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMUB2Q71RG4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms