Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
SynmQ70IV5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC40.81■■■■■ 4.12
SynmQ70IV5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
SynmQ70IV5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
SynmQ70IV5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
SynmQ70IV5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
SynmQ70IV5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.78■■■■■ 4.12
SynmQ70IV5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
SynmQ70IV5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
SynmQ70IV5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
SynmQ70IV5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC40.77■■■■■ 4.12
SynmQ70IV5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.76■■■■■ 4.12
SynmQ70IV5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
SynmQ70IV5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
SynmQ70IV5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
SynmQ70IV5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
SynmQ70IV5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
SynmQ70IV5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
SynmQ70IV5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
SynmQ70IV5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.11
SynmQ70IV5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
SynmQ70IV5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
SynmQ70IV5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
SynmQ70IV5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
SynmQ70IV5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
SynmQ70IV5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
SynmQ70IV5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
SynmQ70IV5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
SynmQ70IV5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
SynmQ70IV5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
SynmQ70IV5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
SynmQ70IV5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
SynmQ70IV5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
SynmQ70IV5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
SynmQ70IV5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
SynmQ70IV5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.09
SynmQ70IV5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
SynmQ70IV5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
SynmQ70IV5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
SynmQ70IV5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
SynmQ70IV5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
SynmQ70IV5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
SynmQ70IV5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
SynmQ70IV5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
SynmQ70IV5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
SynmQ70IV5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
SynmQ70IV5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
SynmQ70IV5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
SynmQ70IV5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
SynmQ70IV5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
SynmQ70IV5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
SynmQ70IV5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
SynmQ70IV5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC40.34■■■■■ 4.05
SynmQ70IV5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
SynmQ70IV5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
SynmQ70IV5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC40.32■■■■■ 4.05
SynmQ70IV5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
SynmQ70IV5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
SynmQ70IV5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
SynmQ70IV5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
SynmQ70IV5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
SynmQ70IV5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
SynmQ70IV5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
SynmQ70IV5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
SynmQ70IV5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
SynmQ70IV5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
SynmQ70IV5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
SynmQ70IV5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
SynmQ70IV5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
SynmQ70IV5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
SynmQ70IV5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
SynmQ70IV5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
SynmQ70IV5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
SynmQ70IV5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
SynmQ70IV5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
SynmQ70IV5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
SynmQ70IV5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
SynmQ70IV5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC40.16■■■■■ 4.02
SynmQ70IV5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
SynmQ70IV5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
SynmQ70IV5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC40.13■■■■■ 4.01
SynmQ70IV5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC40.13■■■■■ 4.01
SynmQ70IV5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
SynmQ70IV5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC40.1■■■■■ 4.01
SynmQ70IV5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
SynmQ70IV5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
SynmQ70IV5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
SynmQ70IV5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
SynmQ70IV5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
SynmQ70IV5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
SynmQ70IV5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
SynmQ70IV5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC40.05■■■■■ 4
SynmQ70IV5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
SynmQ70IV5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
SynmQ70IV5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
SynmQ70IV5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
SynmQ70IV5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.01■■■■■ 4
SynmQ70IV5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC40.01■■■■■ 4
SynmQ70IV5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC39.97■■■■□ 3.99
SynmQ70IV5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms