Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ7

Spcs3, Signal peptidase complex subunit 3, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spcs3Q6ZWQ7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spcs3Q6ZWQ7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spcs3Q6ZWQ7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spcs3Q6ZWQ7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spcs3Q6ZWQ7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spcs3Q6ZWQ7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spcs3Q6ZWQ7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spcs3Q6ZWQ7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spcs3Q6ZWQ7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spcs3Q6ZWQ7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spcs3Q6ZWQ7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spcs3Q6ZWQ7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Spcs3Q6ZWQ7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spcs3Q6ZWQ7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Spcs3Q6ZWQ7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spcs3Q6ZWQ7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spcs3Q6ZWQ7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spcs3Q6ZWQ7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spcs3Q6ZWQ7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spcs3Q6ZWQ7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spcs3Q6ZWQ7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spcs3Q6ZWQ7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spcs3Q6ZWQ7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spcs3Q6ZWQ7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spcs3Q6ZWQ7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spcs3Q6ZWQ7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spcs3Q6ZWQ7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spcs3Q6ZWQ7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spcs3Q6ZWQ7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spcs3Q6ZWQ7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spcs3Q6ZWQ7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spcs3Q6ZWQ7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spcs3Q6ZWQ7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Spcs3Q6ZWQ7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Spcs3Q6ZWQ7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Spcs3Q6ZWQ7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spcs3Q6ZWQ7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spcs3Q6ZWQ7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spcs3Q6ZWQ7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spcs3Q6ZWQ7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spcs3Q6ZWQ7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spcs3Q6ZWQ7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spcs3Q6ZWQ7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spcs3Q6ZWQ7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spcs3Q6ZWQ7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spcs3Q6ZWQ7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spcs3Q6ZWQ7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spcs3Q6ZWQ7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spcs3Q6ZWQ7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spcs3Q6ZWQ7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spcs3Q6ZWQ7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spcs3Q6ZWQ7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spcs3Q6ZWQ7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Spcs3Q6ZWQ7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spcs3Q6ZWQ7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spcs3Q6ZWQ7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spcs3Q6ZWQ7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spcs3Q6ZWQ7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spcs3Q6ZWQ7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spcs3Q6ZWQ7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spcs3Q6ZWQ7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spcs3Q6ZWQ7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spcs3Q6ZWQ7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spcs3Q6ZWQ7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spcs3Q6ZWQ7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spcs3Q6ZWQ7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Spcs3Q6ZWQ7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Spcs3Q6ZWQ7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Spcs3Q6ZWQ7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Spcs3Q6ZWQ7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Spcs3Q6ZWQ7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spcs3Q6ZWQ7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Spcs3Q6ZWQ7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spcs3Q6ZWQ7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spcs3Q6ZWQ7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spcs3Q6ZWQ7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spcs3Q6ZWQ7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spcs3Q6ZWQ7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spcs3Q6ZWQ7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spcs3Q6ZWQ7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spcs3Q6ZWQ7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spcs3Q6ZWQ7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spcs3Q6ZWQ7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Spcs3Q6ZWQ7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spcs3Q6ZWQ7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spcs3Q6ZWQ7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spcs3Q6ZWQ7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spcs3Q6ZWQ7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spcs3Q6ZWQ7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spcs3Q6ZWQ7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spcs3Q6ZWQ7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spcs3Q6ZWQ7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spcs3Q6ZWQ7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Spcs3Q6ZWQ7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Spcs3Q6ZWQ7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Spcs3Q6ZWQ7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Spcs3Q6ZWQ7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Spcs3Q6ZWQ7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Spcs3Q6ZWQ7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Spcs3Q6ZWQ7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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