Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SRCAPQ6ZRS2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SRCAPQ6ZRS2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SRCAPQ6ZRS2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SRCAPQ6ZRS2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SRCAPQ6ZRS2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SRCAPQ6ZRS2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
SRCAPQ6ZRS2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SRCAPQ6ZRS2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
SRCAPQ6ZRS2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SRCAPQ6ZRS2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SRCAPQ6ZRS2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SRCAPQ6ZRS2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SRCAPQ6ZRS2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SRCAPQ6ZRS2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
SRCAPQ6ZRS2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SRCAPQ6ZRS2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SRCAPQ6ZRS2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SRCAPQ6ZRS2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
SRCAPQ6ZRS2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SRCAPQ6ZRS2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SRCAPQ6ZRS2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SRCAPQ6ZRS2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SRCAPQ6ZRS2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SRCAPQ6ZRS2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SRCAPQ6ZRS2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
SRCAPQ6ZRS2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
SRCAPQ6ZRS2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC35■■■■□ 3.19
SRCAPQ6ZRS2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SRCAPQ6ZRS2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SRCAPQ6ZRS2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SRCAPQ6ZRS2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SRCAPQ6ZRS2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SRCAPQ6ZRS2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SRCAPQ6ZRS2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.19
SRCAPQ6ZRS2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SRCAPQ6ZRS2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SRCAPQ6ZRS2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SRCAPQ6ZRS2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SRCAPQ6ZRS2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SRCAPQ6ZRS2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SRCAPQ6ZRS2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SRCAPQ6ZRS2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SRCAPQ6ZRS2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SRCAPQ6ZRS2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SRCAPQ6ZRS2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SRCAPQ6ZRS2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SRCAPQ6ZRS2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SRCAPQ6ZRS2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SRCAPQ6ZRS2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SRCAPQ6ZRS2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SRCAPQ6ZRS2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SRCAPQ6ZRS2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SRCAPQ6ZRS2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SRCAPQ6ZRS2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SRCAPQ6ZRS2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SRCAPQ6ZRS2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
SRCAPQ6ZRS2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SRCAPQ6ZRS2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
SRCAPQ6ZRS2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
SRCAPQ6ZRS2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
SRCAPQ6ZRS2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
SRCAPQ6ZRS2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
SRCAPQ6ZRS2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
SRCAPQ6ZRS2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
SRCAPQ6ZRS2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
SRCAPQ6ZRS2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
SRCAPQ6ZRS2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SRCAPQ6ZRS2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SRCAPQ6ZRS2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
SRCAPQ6ZRS2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SRCAPQ6ZRS2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SRCAPQ6ZRS2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SRCAPQ6ZRS2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
SRCAPQ6ZRS2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SRCAPQ6ZRS2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SRCAPQ6ZRS2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SRCAPQ6ZRS2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SRCAPQ6ZRS2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SRCAPQ6ZRS2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SRCAPQ6ZRS2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
SRCAPQ6ZRS2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SRCAPQ6ZRS2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SRCAPQ6ZRS2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SRCAPQ6ZRS2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SRCAPQ6ZRS2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SRCAPQ6ZRS2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
SRCAPQ6ZRS2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC34.7■■■■□ 3.14
SRCAPQ6ZRS2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SRCAPQ6ZRS2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SRCAPQ6ZRS2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SRCAPQ6ZRS2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SRCAPQ6ZRS2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SRCAPQ6ZRS2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SRCAPQ6ZRS2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SRCAPQ6ZRS2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SRCAPQ6ZRS2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SRCAPQ6ZRS2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SRCAPQ6ZRS2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SRCAPQ6ZRS2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms