Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPG2

Wdr90, WD repeat-containing protein 90, mousemouse

Predictions only

Length 1,874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr90Q6ZPG2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Wdr90Q6ZPG2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Wdr90Q6ZPG2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Wdr90Q6ZPG2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Wdr90Q6ZPG2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Wdr90Q6ZPG2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Wdr90Q6ZPG2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Wdr90Q6ZPG2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Wdr90Q6ZPG2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Wdr90Q6ZPG2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Wdr90Q6ZPG2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Wdr90Q6ZPG2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Wdr90Q6ZPG2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Wdr90Q6ZPG2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Wdr90Q6ZPG2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Wdr90Q6ZPG2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Wdr90Q6ZPG2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Wdr90Q6ZPG2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Wdr90Q6ZPG2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Wdr90Q6ZPG2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Wdr90Q6ZPG2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Wdr90Q6ZPG2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Wdr90Q6ZPG2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Wdr90Q6ZPG2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Wdr90Q6ZPG2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Wdr90Q6ZPG2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Wdr90Q6ZPG2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Wdr90Q6ZPG2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Wdr90Q6ZPG2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Wdr90Q6ZPG2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Wdr90Q6ZPG2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Wdr90Q6ZPG2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Wdr90Q6ZPG2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Wdr90Q6ZPG2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Wdr90Q6ZPG2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Wdr90Q6ZPG2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Wdr90Q6ZPG2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Wdr90Q6ZPG2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Wdr90Q6ZPG2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Wdr90Q6ZPG2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Wdr90Q6ZPG2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Wdr90Q6ZPG2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Wdr90Q6ZPG2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Wdr90Q6ZPG2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Wdr90Q6ZPG2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Wdr90Q6ZPG2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Wdr90Q6ZPG2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Wdr90Q6ZPG2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Wdr90Q6ZPG2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Wdr90Q6ZPG2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Wdr90Q6ZPG2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Wdr90Q6ZPG2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Wdr90Q6ZPG2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Wdr90Q6ZPG2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Wdr90Q6ZPG2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Wdr90Q6ZPG2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Wdr90Q6ZPG2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Wdr90Q6ZPG2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Wdr90Q6ZPG2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Wdr90Q6ZPG2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Wdr90Q6ZPG2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Wdr90Q6ZPG2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Wdr90Q6ZPG2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Wdr90Q6ZPG2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Wdr90Q6ZPG2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Wdr90Q6ZPG2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Wdr90Q6ZPG2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Wdr90Q6ZPG2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Wdr90Q6ZPG2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Wdr90Q6ZPG2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Wdr90Q6ZPG2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
Wdr90Q6ZPG2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Wdr90Q6ZPG2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Wdr90Q6ZPG2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Wdr90Q6ZPG2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Wdr90Q6ZPG2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Wdr90Q6ZPG2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Wdr90Q6ZPG2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Wdr90Q6ZPG2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Wdr90Q6ZPG2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Wdr90Q6ZPG2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Wdr90Q6ZPG2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Wdr90Q6ZPG2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Wdr90Q6ZPG2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Wdr90Q6ZPG2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Wdr90Q6ZPG2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Wdr90Q6ZPG2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Wdr90Q6ZPG2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Wdr90Q6ZPG2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Wdr90Q6ZPG2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Wdr90Q6ZPG2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Wdr90Q6ZPG2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Wdr90Q6ZPG2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Wdr90Q6ZPG2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Wdr90Q6ZPG2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Wdr90Q6ZPG2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Wdr90Q6ZPG2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Wdr90Q6ZPG2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Wdr90Q6ZPG2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Wdr90Q6ZPG2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms