Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMK1

CYHR1, Cysteine and histidine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYHR1Q6ZMK1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CYHR1Q6ZMK1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYHR1Q6ZMK1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYHR1Q6ZMK1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYHR1Q6ZMK1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYHR1Q6ZMK1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYHR1Q6ZMK1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYHR1Q6ZMK1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYHR1Q6ZMK1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYHR1Q6ZMK1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYHR1Q6ZMK1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYHR1Q6ZMK1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYHR1Q6ZMK1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYHR1Q6ZMK1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYHR1Q6ZMK1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYHR1Q6ZMK1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CYHR1Q6ZMK1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYHR1Q6ZMK1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYHR1Q6ZMK1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYHR1Q6ZMK1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYHR1Q6ZMK1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYHR1Q6ZMK1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CYHR1Q6ZMK1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CYHR1Q6ZMK1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CYHR1Q6ZMK1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CYHR1Q6ZMK1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CYHR1Q6ZMK1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CYHR1Q6ZMK1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CYHR1Q6ZMK1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CYHR1Q6ZMK1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CYHR1Q6ZMK1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CYHR1Q6ZMK1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CYHR1Q6ZMK1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CYHR1Q6ZMK1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CYHR1Q6ZMK1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CYHR1Q6ZMK1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYHR1Q6ZMK1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYHR1Q6ZMK1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CYHR1Q6ZMK1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYHR1Q6ZMK1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYHR1Q6ZMK1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYHR1Q6ZMK1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CYHR1Q6ZMK1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYHR1Q6ZMK1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYHR1Q6ZMK1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYHR1Q6ZMK1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYHR1Q6ZMK1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYHR1Q6ZMK1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYHR1Q6ZMK1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYHR1Q6ZMK1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYHR1Q6ZMK1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYHR1Q6ZMK1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYHR1Q6ZMK1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYHR1Q6ZMK1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYHR1Q6ZMK1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYHR1Q6ZMK1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYHR1Q6ZMK1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYHR1Q6ZMK1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYHR1Q6ZMK1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYHR1Q6ZMK1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYHR1Q6ZMK1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CYHR1Q6ZMK1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYHR1Q6ZMK1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CYHR1Q6ZMK1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYHR1Q6ZMK1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYHR1Q6ZMK1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYHR1Q6ZMK1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYHR1Q6ZMK1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYHR1Q6ZMK1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYHR1Q6ZMK1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYHR1Q6ZMK1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYHR1Q6ZMK1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYHR1Q6ZMK1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYHR1Q6ZMK1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CYHR1Q6ZMK1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYHR1Q6ZMK1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYHR1Q6ZMK1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYHR1Q6ZMK1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYHR1Q6ZMK1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYHR1Q6ZMK1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYHR1Q6ZMK1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYHR1Q6ZMK1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYHR1Q6ZMK1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYHR1Q6ZMK1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYHR1Q6ZMK1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYHR1Q6ZMK1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYHR1Q6ZMK1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYHR1Q6ZMK1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYHR1Q6ZMK1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYHR1Q6ZMK1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYHR1Q6ZMK1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYHR1Q6ZMK1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYHR1Q6ZMK1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYHR1Q6ZMK1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYHR1Q6ZMK1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYHR1Q6ZMK1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYHR1Q6ZMK1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYHR1Q6ZMK1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYHR1Q6ZMK1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYHR1Q6ZMK1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms