Protein–RNA interactions for Protein: Q6XD76

ASCL4, Achaete-scute homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL4Q6XD76 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ASCL4Q6XD76 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ASCL4Q6XD76 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ASCL4Q6XD76 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASCL4Q6XD76 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASCL4Q6XD76 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASCL4Q6XD76 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASCL4Q6XD76 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASCL4Q6XD76 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASCL4Q6XD76 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASCL4Q6XD76 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASCL4Q6XD76 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASCL4Q6XD76 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASCL4Q6XD76 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASCL4Q6XD76 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASCL4Q6XD76 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASCL4Q6XD76 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ASCL4Q6XD76 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASCL4Q6XD76 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASCL4Q6XD76 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASCL4Q6XD76 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASCL4Q6XD76 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASCL4Q6XD76 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ASCL4Q6XD76 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASCL4Q6XD76 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASCL4Q6XD76 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASCL4Q6XD76 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASCL4Q6XD76 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASCL4Q6XD76 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASCL4Q6XD76 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASCL4Q6XD76 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASCL4Q6XD76 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASCL4Q6XD76 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASCL4Q6XD76 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASCL4Q6XD76 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASCL4Q6XD76 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASCL4Q6XD76 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASCL4Q6XD76 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASCL4Q6XD76 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASCL4Q6XD76 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASCL4Q6XD76 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASCL4Q6XD76 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASCL4Q6XD76 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASCL4Q6XD76 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASCL4Q6XD76 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASCL4Q6XD76 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASCL4Q6XD76 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASCL4Q6XD76 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASCL4Q6XD76 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASCL4Q6XD76 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASCL4Q6XD76 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASCL4Q6XD76 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASCL4Q6XD76 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASCL4Q6XD76 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASCL4Q6XD76 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASCL4Q6XD76 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASCL4Q6XD76 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASCL4Q6XD76 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASCL4Q6XD76 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASCL4Q6XD76 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ASCL4Q6XD76 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASCL4Q6XD76 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASCL4Q6XD76 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASCL4Q6XD76 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASCL4Q6XD76 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASCL4Q6XD76 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASCL4Q6XD76 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASCL4Q6XD76 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASCL4Q6XD76 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASCL4Q6XD76 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASCL4Q6XD76 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASCL4Q6XD76 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASCL4Q6XD76 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASCL4Q6XD76 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASCL4Q6XD76 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASCL4Q6XD76 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASCL4Q6XD76 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASCL4Q6XD76 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASCL4Q6XD76 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASCL4Q6XD76 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ASCL4Q6XD76 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASCL4Q6XD76 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASCL4Q6XD76 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASCL4Q6XD76 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASCL4Q6XD76 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASCL4Q6XD76 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASCL4Q6XD76 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ASCL4Q6XD76 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASCL4Q6XD76 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASCL4Q6XD76 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASCL4Q6XD76 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ASCL4Q6XD76 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASCL4Q6XD76 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ASCL4Q6XD76 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASCL4Q6XD76 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASCL4Q6XD76 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASCL4Q6XD76 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASCL4Q6XD76 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASCL4Q6XD76 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASCL4Q6XD76 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms