Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY09

CEACAM20, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM20Q6UY09 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEACAM20Q6UY09 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CEACAM20Q6UY09 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CEACAM20Q6UY09 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CEACAM20Q6UY09 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CEACAM20Q6UY09 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CEACAM20Q6UY09 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CEACAM20Q6UY09 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CEACAM20Q6UY09 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CEACAM20Q6UY09 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CEACAM20Q6UY09 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CEACAM20Q6UY09 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CEACAM20Q6UY09 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CEACAM20Q6UY09 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CEACAM20Q6UY09 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEACAM20Q6UY09 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEACAM20Q6UY09 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEACAM20Q6UY09 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEACAM20Q6UY09 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEACAM20Q6UY09 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEACAM20Q6UY09 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEACAM20Q6UY09 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEACAM20Q6UY09 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEACAM20Q6UY09 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEACAM20Q6UY09 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEACAM20Q6UY09 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEACAM20Q6UY09 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEACAM20Q6UY09 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEACAM20Q6UY09 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEACAM20Q6UY09 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEACAM20Q6UY09 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEACAM20Q6UY09 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEACAM20Q6UY09 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEACAM20Q6UY09 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CEACAM20Q6UY09 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CEACAM20Q6UY09 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CEACAM20Q6UY09 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEACAM20Q6UY09 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEACAM20Q6UY09 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CEACAM20Q6UY09 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CEACAM20Q6UY09 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEACAM20Q6UY09 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEACAM20Q6UY09 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEACAM20Q6UY09 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CEACAM20Q6UY09 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CEACAM20Q6UY09 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CEACAM20Q6UY09 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEACAM20Q6UY09 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEACAM20Q6UY09 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CEACAM20Q6UY09 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CEACAM20Q6UY09 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CEACAM20Q6UY09 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CEACAM20Q6UY09 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CEACAM20Q6UY09 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CEACAM20Q6UY09 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CEACAM20Q6UY09 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CEACAM20Q6UY09 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CEACAM20Q6UY09 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CEACAM20Q6UY09 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEACAM20Q6UY09 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CEACAM20Q6UY09 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEACAM20Q6UY09 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEACAM20Q6UY09 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEACAM20Q6UY09 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEACAM20Q6UY09 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CEACAM20Q6UY09 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEACAM20Q6UY09 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEACAM20Q6UY09 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEACAM20Q6UY09 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEACAM20Q6UY09 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEACAM20Q6UY09 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEACAM20Q6UY09 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEACAM20Q6UY09 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEACAM20Q6UY09 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEACAM20Q6UY09 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEACAM20Q6UY09 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEACAM20Q6UY09 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEACAM20Q6UY09 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEACAM20Q6UY09 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEACAM20Q6UY09 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEACAM20Q6UY09 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEACAM20Q6UY09 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEACAM20Q6UY09 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEACAM20Q6UY09 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CEACAM20Q6UY09 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEACAM20Q6UY09 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEACAM20Q6UY09 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEACAM20Q6UY09 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEACAM20Q6UY09 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEACAM20Q6UY09 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEACAM20Q6UY09 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEACAM20Q6UY09 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEACAM20Q6UY09 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEACAM20Q6UY09 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEACAM20Q6UY09 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEACAM20Q6UY09 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEACAM20Q6UY09 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEACAM20Q6UY09 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CEACAM20Q6UY09 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEACAM20Q6UY09 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms