Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXU4

GSG1L, Germ cell-specific gene 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSG1LQ6UXU4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSG1LQ6UXU4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSG1LQ6UXU4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSG1LQ6UXU4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSG1LQ6UXU4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSG1LQ6UXU4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSG1LQ6UXU4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSG1LQ6UXU4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSG1LQ6UXU4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GSG1LQ6UXU4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSG1LQ6UXU4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSG1LQ6UXU4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSG1LQ6UXU4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSG1LQ6UXU4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSG1LQ6UXU4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSG1LQ6UXU4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSG1LQ6UXU4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSG1LQ6UXU4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSG1LQ6UXU4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSG1LQ6UXU4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSG1LQ6UXU4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSG1LQ6UXU4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSG1LQ6UXU4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSG1LQ6UXU4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSG1LQ6UXU4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSG1LQ6UXU4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSG1LQ6UXU4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSG1LQ6UXU4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSG1LQ6UXU4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSG1LQ6UXU4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSG1LQ6UXU4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSG1LQ6UXU4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSG1LQ6UXU4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSG1LQ6UXU4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GSG1LQ6UXU4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSG1LQ6UXU4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSG1LQ6UXU4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GSG1LQ6UXU4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSG1LQ6UXU4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSG1LQ6UXU4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSG1LQ6UXU4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSG1LQ6UXU4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSG1LQ6UXU4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSG1LQ6UXU4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSG1LQ6UXU4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GSG1LQ6UXU4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSG1LQ6UXU4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSG1LQ6UXU4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSG1LQ6UXU4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSG1LQ6UXU4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSG1LQ6UXU4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSG1LQ6UXU4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GSG1LQ6UXU4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSG1LQ6UXU4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSG1LQ6UXU4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSG1LQ6UXU4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSG1LQ6UXU4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSG1LQ6UXU4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSG1LQ6UXU4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSG1LQ6UXU4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSG1LQ6UXU4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSG1LQ6UXU4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSG1LQ6UXU4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSG1LQ6UXU4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSG1LQ6UXU4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSG1LQ6UXU4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSG1LQ6UXU4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSG1LQ6UXU4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSG1LQ6UXU4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSG1LQ6UXU4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSG1LQ6UXU4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSG1LQ6UXU4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSG1LQ6UXU4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GSG1LQ6UXU4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSG1LQ6UXU4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GSG1LQ6UXU4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GSG1LQ6UXU4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms