Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX73

C16orf89, UPF0764 protein C16orf89, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf89Q6UX73 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C16orf89Q6UX73 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C16orf89Q6UX73 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C16orf89Q6UX73 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
C16orf89Q6UX73 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C16orf89Q6UX73 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C16orf89Q6UX73 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C16orf89Q6UX73 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C16orf89Q6UX73 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C16orf89Q6UX73 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C16orf89Q6UX73 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C16orf89Q6UX73 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C16orf89Q6UX73 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C16orf89Q6UX73 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C16orf89Q6UX73 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C16orf89Q6UX73 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C16orf89Q6UX73 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C16orf89Q6UX73 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C16orf89Q6UX73 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C16orf89Q6UX73 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C16orf89Q6UX73 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C16orf89Q6UX73 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C16orf89Q6UX73 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C16orf89Q6UX73 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C16orf89Q6UX73 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C16orf89Q6UX73 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C16orf89Q6UX73 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C16orf89Q6UX73 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C16orf89Q6UX73 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C16orf89Q6UX73 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C16orf89Q6UX73 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C16orf89Q6UX73 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C16orf89Q6UX73 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
C16orf89Q6UX73 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C16orf89Q6UX73 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C16orf89Q6UX73 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C16orf89Q6UX73 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C16orf89Q6UX73 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C16orf89Q6UX73 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C16orf89Q6UX73 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C16orf89Q6UX73 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C16orf89Q6UX73 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C16orf89Q6UX73 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C16orf89Q6UX73 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C16orf89Q6UX73 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C16orf89Q6UX73 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
C16orf89Q6UX73 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
C16orf89Q6UX73 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C16orf89Q6UX73 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C16orf89Q6UX73 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C16orf89Q6UX73 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C16orf89Q6UX73 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C16orf89Q6UX73 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C16orf89Q6UX73 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C16orf89Q6UX73 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C16orf89Q6UX73 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C16orf89Q6UX73 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C16orf89Q6UX73 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C16orf89Q6UX73 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C16orf89Q6UX73 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C16orf89Q6UX73 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C16orf89Q6UX73 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C16orf89Q6UX73 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C16orf89Q6UX73 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C16orf89Q6UX73 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C16orf89Q6UX73 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C16orf89Q6UX73 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C16orf89Q6UX73 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C16orf89Q6UX73 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C16orf89Q6UX73 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C16orf89Q6UX73 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C16orf89Q6UX73 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C16orf89Q6UX73 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C16orf89Q6UX73 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C16orf89Q6UX73 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C16orf89Q6UX73 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C16orf89Q6UX73 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C16orf89Q6UX73 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
C16orf89Q6UX73 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
C16orf89Q6UX73 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C16orf89Q6UX73 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C16orf89Q6UX73 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
C16orf89Q6UX73 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C16orf89Q6UX73 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C16orf89Q6UX73 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C16orf89Q6UX73 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C16orf89Q6UX73 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C16orf89Q6UX73 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C16orf89Q6UX73 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C16orf89Q6UX73 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C16orf89Q6UX73 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C16orf89Q6UX73 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C16orf89Q6UX73 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C16orf89Q6UX73 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C16orf89Q6UX73 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C16orf89Q6UX73 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C16orf89Q6UX73 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C16orf89Q6UX73 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C16orf89Q6UX73 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C16orf89Q6UX73 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms