Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW60

PCSK4, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 4, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK4Q6UW60 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCSK4Q6UW60 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCSK4Q6UW60 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PCSK4Q6UW60 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCSK4Q6UW60 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCSK4Q6UW60 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCSK4Q6UW60 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCSK4Q6UW60 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCSK4Q6UW60 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCSK4Q6UW60 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCSK4Q6UW60 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCSK4Q6UW60 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCSK4Q6UW60 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCSK4Q6UW60 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCSK4Q6UW60 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCSK4Q6UW60 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCSK4Q6UW60 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCSK4Q6UW60 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCSK4Q6UW60 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCSK4Q6UW60 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PCSK4Q6UW60 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PCSK4Q6UW60 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCSK4Q6UW60 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCSK4Q6UW60 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PCSK4Q6UW60 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCSK4Q6UW60 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCSK4Q6UW60 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCSK4Q6UW60 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCSK4Q6UW60 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCSK4Q6UW60 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCSK4Q6UW60 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCSK4Q6UW60 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PCSK4Q6UW60 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCSK4Q6UW60 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCSK4Q6UW60 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCSK4Q6UW60 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCSK4Q6UW60 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCSK4Q6UW60 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCSK4Q6UW60 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCSK4Q6UW60 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCSK4Q6UW60 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCSK4Q6UW60 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCSK4Q6UW60 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCSK4Q6UW60 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCSK4Q6UW60 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCSK4Q6UW60 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCSK4Q6UW60 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCSK4Q6UW60 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCSK4Q6UW60 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCSK4Q6UW60 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCSK4Q6UW60 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCSK4Q6UW60 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCSK4Q6UW60 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCSK4Q6UW60 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCSK4Q6UW60 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCSK4Q6UW60 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCSK4Q6UW60 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCSK4Q6UW60 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCSK4Q6UW60 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PCSK4Q6UW60 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCSK4Q6UW60 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCSK4Q6UW60 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PCSK4Q6UW60 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PCSK4Q6UW60 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PCSK4Q6UW60 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PCSK4Q6UW60 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PCSK4Q6UW60 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PCSK4Q6UW60 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PCSK4Q6UW60 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PCSK4Q6UW60 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCSK4Q6UW60 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCSK4Q6UW60 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCSK4Q6UW60 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCSK4Q6UW60 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCSK4Q6UW60 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCSK4Q6UW60 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCSK4Q6UW60 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCSK4Q6UW60 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCSK4Q6UW60 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCSK4Q6UW60 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCSK4Q6UW60 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCSK4Q6UW60 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCSK4Q6UW60 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCSK4Q6UW60 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCSK4Q6UW60 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCSK4Q6UW60 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCSK4Q6UW60 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCSK4Q6UW60 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCSK4Q6UW60 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCSK4Q6UW60 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCSK4Q6UW60 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCSK4Q6UW60 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCSK4Q6UW60 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCSK4Q6UW60 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCSK4Q6UW60 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCSK4Q6UW60 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCSK4Q6UW60 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PCSK4Q6UW60 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCSK4Q6UW60 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PCSK4Q6UW60 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms