Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY0

BLOC1S3, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S3Q6QNY0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BLOC1S3Q6QNY0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BLOC1S3Q6QNY0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BLOC1S3Q6QNY0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BLOC1S3Q6QNY0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BLOC1S3Q6QNY0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BLOC1S3Q6QNY0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BLOC1S3Q6QNY0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BLOC1S3Q6QNY0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BLOC1S3Q6QNY0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BLOC1S3Q6QNY0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BLOC1S3Q6QNY0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BLOC1S3Q6QNY0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BLOC1S3Q6QNY0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BLOC1S3Q6QNY0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BLOC1S3Q6QNY0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BLOC1S3Q6QNY0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BLOC1S3Q6QNY0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BLOC1S3Q6QNY0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BLOC1S3Q6QNY0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BLOC1S3Q6QNY0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BLOC1S3Q6QNY0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BLOC1S3Q6QNY0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BLOC1S3Q6QNY0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BLOC1S3Q6QNY0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BLOC1S3Q6QNY0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BLOC1S3Q6QNY0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BLOC1S3Q6QNY0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BLOC1S3Q6QNY0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BLOC1S3Q6QNY0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BLOC1S3Q6QNY0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BLOC1S3Q6QNY0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BLOC1S3Q6QNY0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BLOC1S3Q6QNY0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BLOC1S3Q6QNY0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BLOC1S3Q6QNY0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BLOC1S3Q6QNY0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BLOC1S3Q6QNY0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BLOC1S3Q6QNY0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BLOC1S3Q6QNY0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BLOC1S3Q6QNY0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BLOC1S3Q6QNY0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BLOC1S3Q6QNY0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BLOC1S3Q6QNY0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BLOC1S3Q6QNY0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BLOC1S3Q6QNY0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
BLOC1S3Q6QNY0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BLOC1S3Q6QNY0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BLOC1S3Q6QNY0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BLOC1S3Q6QNY0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BLOC1S3Q6QNY0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BLOC1S3Q6QNY0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BLOC1S3Q6QNY0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BLOC1S3Q6QNY0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BLOC1S3Q6QNY0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BLOC1S3Q6QNY0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BLOC1S3Q6QNY0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BLOC1S3Q6QNY0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BLOC1S3Q6QNY0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BLOC1S3Q6QNY0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BLOC1S3Q6QNY0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BLOC1S3Q6QNY0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BLOC1S3Q6QNY0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BLOC1S3Q6QNY0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BLOC1S3Q6QNY0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BLOC1S3Q6QNY0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BLOC1S3Q6QNY0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BLOC1S3Q6QNY0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BLOC1S3Q6QNY0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BLOC1S3Q6QNY0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BLOC1S3Q6QNY0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BLOC1S3Q6QNY0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BLOC1S3Q6QNY0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BLOC1S3Q6QNY0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BLOC1S3Q6QNY0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BLOC1S3Q6QNY0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BLOC1S3Q6QNY0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BLOC1S3Q6QNY0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BLOC1S3Q6QNY0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BLOC1S3Q6QNY0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BLOC1S3Q6QNY0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BLOC1S3Q6QNY0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BLOC1S3Q6QNY0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BLOC1S3Q6QNY0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BLOC1S3Q6QNY0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BLOC1S3Q6QNY0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BLOC1S3Q6QNY0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BLOC1S3Q6QNY0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BLOC1S3Q6QNY0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BLOC1S3Q6QNY0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BLOC1S3Q6QNY0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BLOC1S3Q6QNY0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BLOC1S3Q6QNY0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BLOC1S3Q6QNY0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BLOC1S3Q6QNY0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BLOC1S3Q6QNY0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BLOC1S3Q6QNY0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BLOC1S3Q6QNY0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BLOC1S3Q6QNY0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BLOC1S3Q6QNY0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms