Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc57Q6PHN1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc57Q6PHN1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc57Q6PHN1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc57Q6PHN1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc57Q6PHN1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc57Q6PHN1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc57Q6PHN1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc57Q6PHN1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc57Q6PHN1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc57Q6PHN1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc57Q6PHN1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc57Q6PHN1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc57Q6PHN1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc57Q6PHN1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc57Q6PHN1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc57Q6PHN1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc57Q6PHN1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc57Q6PHN1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc57Q6PHN1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ccdc57Q6PHN1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc57Q6PHN1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc57Q6PHN1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc57Q6PHN1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc57Q6PHN1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc57Q6PHN1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc57Q6PHN1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc57Q6PHN1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc57Q6PHN1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc57Q6PHN1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc57Q6PHN1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc57Q6PHN1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc57Q6PHN1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc57Q6PHN1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc57Q6PHN1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc57Q6PHN1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc57Q6PHN1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc57Q6PHN1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc57Q6PHN1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc57Q6PHN1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc57Q6PHN1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc57Q6PHN1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc57Q6PHN1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc57Q6PHN1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc57Q6PHN1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc57Q6PHN1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc57Q6PHN1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc57Q6PHN1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc57Q6PHN1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc57Q6PHN1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc57Q6PHN1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc57Q6PHN1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc57Q6PHN1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc57Q6PHN1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc57Q6PHN1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc57Q6PHN1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc57Q6PHN1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc57Q6PHN1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc57Q6PHN1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc57Q6PHN1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc57Q6PHN1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc57Q6PHN1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc57Q6PHN1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc57Q6PHN1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc57Q6PHN1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc57Q6PHN1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc57Q6PHN1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc57Q6PHN1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc57Q6PHN1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc57Q6PHN1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc57Q6PHN1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc57Q6PHN1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc57Q6PHN1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc57Q6PHN1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc57Q6PHN1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc57Q6PHN1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc57Q6PHN1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc57Q6PHN1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc57Q6PHN1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc57Q6PHN1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc57Q6PHN1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc57Q6PHN1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc57Q6PHN1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc57Q6PHN1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc57Q6PHN1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc57Q6PHN1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc57Q6PHN1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc57Q6PHN1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc57Q6PHN1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc57Q6PHN1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc57Q6PHN1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc57Q6PHN1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc57Q6PHN1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc57Q6PHN1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc57Q6PHN1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc57Q6PHN1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc57Q6PHN1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc57Q6PHN1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc57Q6PHN1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc57Q6PHN1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms