Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZCCHC12Q6PEW1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZCCHC12Q6PEW1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZCCHC12Q6PEW1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZCCHC12Q6PEW1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZCCHC12Q6PEW1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZCCHC12Q6PEW1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZCCHC12Q6PEW1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZCCHC12Q6PEW1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZCCHC12Q6PEW1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ZCCHC12Q6PEW1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZCCHC12Q6PEW1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZCCHC12Q6PEW1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZCCHC12Q6PEW1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZCCHC12Q6PEW1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ZCCHC12Q6PEW1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZCCHC12Q6PEW1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZCCHC12Q6PEW1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZCCHC12Q6PEW1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZCCHC12Q6PEW1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZCCHC12Q6PEW1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZCCHC12Q6PEW1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZCCHC12Q6PEW1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZCCHC12Q6PEW1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZCCHC12Q6PEW1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZCCHC12Q6PEW1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZCCHC12Q6PEW1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZCCHC12Q6PEW1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZCCHC12Q6PEW1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZCCHC12Q6PEW1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ZCCHC12Q6PEW1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZCCHC12Q6PEW1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZCCHC12Q6PEW1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZCCHC12Q6PEW1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZCCHC12Q6PEW1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZCCHC12Q6PEW1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZCCHC12Q6PEW1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZCCHC12Q6PEW1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZCCHC12Q6PEW1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZCCHC12Q6PEW1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZCCHC12Q6PEW1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZCCHC12Q6PEW1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZCCHC12Q6PEW1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZCCHC12Q6PEW1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZCCHC12Q6PEW1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZCCHC12Q6PEW1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZCCHC12Q6PEW1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZCCHC12Q6PEW1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZCCHC12Q6PEW1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZCCHC12Q6PEW1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZCCHC12Q6PEW1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZCCHC12Q6PEW1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZCCHC12Q6PEW1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZCCHC12Q6PEW1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZCCHC12Q6PEW1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZCCHC12Q6PEW1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZCCHC12Q6PEW1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZCCHC12Q6PEW1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZCCHC12Q6PEW1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZCCHC12Q6PEW1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZCCHC12Q6PEW1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZCCHC12Q6PEW1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZCCHC12Q6PEW1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZCCHC12Q6PEW1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZCCHC12Q6PEW1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZCCHC12Q6PEW1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZCCHC12Q6PEW1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZCCHC12Q6PEW1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZCCHC12Q6PEW1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZCCHC12Q6PEW1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZCCHC12Q6PEW1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZCCHC12Q6PEW1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZCCHC12Q6PEW1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZCCHC12Q6PEW1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZCCHC12Q6PEW1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC12Q6PEW1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC12Q6PEW1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC12Q6PEW1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC12Q6PEW1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZCCHC12Q6PEW1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZCCHC12Q6PEW1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZCCHC12Q6PEW1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZCCHC12Q6PEW1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZCCHC12Q6PEW1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZCCHC12Q6PEW1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZCCHC12Q6PEW1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZCCHC12Q6PEW1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZCCHC12Q6PEW1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZCCHC12Q6PEW1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZCCHC12Q6PEW1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZCCHC12Q6PEW1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZCCHC12Q6PEW1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ZCCHC12Q6PEW1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZCCHC12Q6PEW1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZCCHC12Q6PEW1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZCCHC12Q6PEW1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZCCHC12Q6PEW1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZCCHC12Q6PEW1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms