Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE3

Rrm2b, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrm2bQ6PEE3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrm2bQ6PEE3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrm2bQ6PEE3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrm2bQ6PEE3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrm2bQ6PEE3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrm2bQ6PEE3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrm2bQ6PEE3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrm2bQ6PEE3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrm2bQ6PEE3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrm2bQ6PEE3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrm2bQ6PEE3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrm2bQ6PEE3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrm2bQ6PEE3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrm2bQ6PEE3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrm2bQ6PEE3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrm2bQ6PEE3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrm2bQ6PEE3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrm2bQ6PEE3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrm2bQ6PEE3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrm2bQ6PEE3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrm2bQ6PEE3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrm2bQ6PEE3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrm2bQ6PEE3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrm2bQ6PEE3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrm2bQ6PEE3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrm2bQ6PEE3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrm2bQ6PEE3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrm2bQ6PEE3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrm2bQ6PEE3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrm2bQ6PEE3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrm2bQ6PEE3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrm2bQ6PEE3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrm2bQ6PEE3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrm2bQ6PEE3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrm2bQ6PEE3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrm2bQ6PEE3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrm2bQ6PEE3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrm2bQ6PEE3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrm2bQ6PEE3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrm2bQ6PEE3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrm2bQ6PEE3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrm2bQ6PEE3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrm2bQ6PEE3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrm2bQ6PEE3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrm2bQ6PEE3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrm2bQ6PEE3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrm2bQ6PEE3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrm2bQ6PEE3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrm2bQ6PEE3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrm2bQ6PEE3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrm2bQ6PEE3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrm2bQ6PEE3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrm2bQ6PEE3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrm2bQ6PEE3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrm2bQ6PEE3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrm2bQ6PEE3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrm2bQ6PEE3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrm2bQ6PEE3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrm2bQ6PEE3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrm2bQ6PEE3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrm2bQ6PEE3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrm2bQ6PEE3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrm2bQ6PEE3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrm2bQ6PEE3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrm2bQ6PEE3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rrm2bQ6PEE3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrm2bQ6PEE3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrm2bQ6PEE3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrm2bQ6PEE3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rrm2bQ6PEE3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rrm2bQ6PEE3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrm2bQ6PEE3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrm2bQ6PEE3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrm2bQ6PEE3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrm2bQ6PEE3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rrm2bQ6PEE3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rrm2bQ6PEE3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rrm2bQ6PEE3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrm2bQ6PEE3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrm2bQ6PEE3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rrm2bQ6PEE3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rrm2bQ6PEE3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrm2bQ6PEE3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrm2bQ6PEE3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrm2bQ6PEE3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rrm2bQ6PEE3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rrm2bQ6PEE3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrm2bQ6PEE3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rrm2bQ6PEE3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rrm2bQ6PEE3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rrm2bQ6PEE3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rrm2bQ6PEE3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rrm2bQ6PEE3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rrm2bQ6PEE3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rrm2bQ6PEE3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rrm2bQ6PEE3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rrm2bQ6PEE3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rrm2bQ6PEE3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rrm2bQ6PEE3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rrm2bQ6PEE3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms