Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Smarcc2Q6PDG5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Smarcc2Q6PDG5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Smarcc2Q6PDG5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Smarcc2Q6PDG5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Smarcc2Q6PDG5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Smarcc2Q6PDG5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Smarcc2Q6PDG5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Smarcc2Q6PDG5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Smarcc2Q6PDG5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Smarcc2Q6PDG5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Smarcc2Q6PDG5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Smarcc2Q6PDG5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Smarcc2Q6PDG5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Smarcc2Q6PDG5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Smarcc2Q6PDG5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Smarcc2Q6PDG5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Smarcc2Q6PDG5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Smarcc2Q6PDG5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Smarcc2Q6PDG5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Smarcc2Q6PDG5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Smarcc2Q6PDG5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Smarcc2Q6PDG5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Smarcc2Q6PDG5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Smarcc2Q6PDG5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Smarcc2Q6PDG5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Smarcc2Q6PDG5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Smarcc2Q6PDG5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Smarcc2Q6PDG5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Smarcc2Q6PDG5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Smarcc2Q6PDG5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Smarcc2Q6PDG5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Smarcc2Q6PDG5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Smarcc2Q6PDG5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Smarcc2Q6PDG5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Smarcc2Q6PDG5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Smarcc2Q6PDG5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Smarcc2Q6PDG5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Smarcc2Q6PDG5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Smarcc2Q6PDG5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Smarcc2Q6PDG5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Smarcc2Q6PDG5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Smarcc2Q6PDG5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Smarcc2Q6PDG5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Smarcc2Q6PDG5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Smarcc2Q6PDG5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Smarcc2Q6PDG5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Smarcc2Q6PDG5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Smarcc2Q6PDG5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Smarcc2Q6PDG5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Smarcc2Q6PDG5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Smarcc2Q6PDG5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Smarcc2Q6PDG5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Smarcc2Q6PDG5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Smarcc2Q6PDG5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Smarcc2Q6PDG5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Smarcc2Q6PDG5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Smarcc2Q6PDG5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Smarcc2Q6PDG5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Smarcc2Q6PDG5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Smarcc2Q6PDG5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Smarcc2Q6PDG5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Smarcc2Q6PDG5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Smarcc2Q6PDG5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Smarcc2Q6PDG5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Smarcc2Q6PDG5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Smarcc2Q6PDG5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Smarcc2Q6PDG5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Smarcc2Q6PDG5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Smarcc2Q6PDG5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Smarcc2Q6PDG5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Smarcc2Q6PDG5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Smarcc2Q6PDG5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Smarcc2Q6PDG5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Smarcc2Q6PDG5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Smarcc2Q6PDG5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Smarcc2Q6PDG5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Smarcc2Q6PDG5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Smarcc2Q6PDG5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Smarcc2Q6PDG5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Smarcc2Q6PDG5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Smarcc2Q6PDG5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Smarcc2Q6PDG5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Smarcc2Q6PDG5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Smarcc2Q6PDG5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Smarcc2Q6PDG5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Smarcc2Q6PDG5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Smarcc2Q6PDG5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Smarcc2Q6PDG5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Smarcc2Q6PDG5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Smarcc2Q6PDG5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Smarcc2Q6PDG5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Smarcc2Q6PDG5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Smarcc2Q6PDG5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Smarcc2Q6PDG5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Smarcc2Q6PDG5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Smarcc2Q6PDG5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Smarcc2Q6PDG5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Smarcc2Q6PDG5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Smarcc2Q6PDG5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.3 ms