Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Zbtb40Q6PCS8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Zbtb40Q6PCS8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Zbtb40Q6PCS8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Zbtb40Q6PCS8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Zbtb40Q6PCS8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Zbtb40Q6PCS8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Zbtb40Q6PCS8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Zbtb40Q6PCS8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Zbtb40Q6PCS8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Zbtb40Q6PCS8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Zbtb40Q6PCS8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Zbtb40Q6PCS8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Zbtb40Q6PCS8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Zbtb40Q6PCS8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Zbtb40Q6PCS8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Zbtb40Q6PCS8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Zbtb40Q6PCS8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Zbtb40Q6PCS8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Zbtb40Q6PCS8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Zbtb40Q6PCS8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Zbtb40Q6PCS8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Zbtb40Q6PCS8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Zbtb40Q6PCS8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Zbtb40Q6PCS8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Zbtb40Q6PCS8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Zbtb40Q6PCS8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Zbtb40Q6PCS8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Zbtb40Q6PCS8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Zbtb40Q6PCS8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Zbtb40Q6PCS8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Zbtb40Q6PCS8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Zbtb40Q6PCS8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
Zbtb40Q6PCS8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Zbtb40Q6PCS8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Zbtb40Q6PCS8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Zbtb40Q6PCS8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Zbtb40Q6PCS8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Zbtb40Q6PCS8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Zbtb40Q6PCS8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Zbtb40Q6PCS8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Zbtb40Q6PCS8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Zbtb40Q6PCS8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Zbtb40Q6PCS8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Zbtb40Q6PCS8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Zbtb40Q6PCS8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Zbtb40Q6PCS8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Zbtb40Q6PCS8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Zbtb40Q6PCS8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Zbtb40Q6PCS8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Zbtb40Q6PCS8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Zbtb40Q6PCS8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Zbtb40Q6PCS8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Zbtb40Q6PCS8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Zbtb40Q6PCS8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Zbtb40Q6PCS8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Zbtb40Q6PCS8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Zbtb40Q6PCS8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Zbtb40Q6PCS8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Zbtb40Q6PCS8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Zbtb40Q6PCS8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Zbtb40Q6PCS8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Zbtb40Q6PCS8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
Zbtb40Q6PCS8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Zbtb40Q6PCS8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Zbtb40Q6PCS8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Zbtb40Q6PCS8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Zbtb40Q6PCS8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Zbtb40Q6PCS8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Zbtb40Q6PCS8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Zbtb40Q6PCS8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Zbtb40Q6PCS8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Zbtb40Q6PCS8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Zbtb40Q6PCS8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Zbtb40Q6PCS8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Zbtb40Q6PCS8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Zbtb40Q6PCS8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Zbtb40Q6PCS8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Zbtb40Q6PCS8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Zbtb40Q6PCS8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Zbtb40Q6PCS8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Zbtb40Q6PCS8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Zbtb40Q6PCS8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Zbtb40Q6PCS8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Zbtb40Q6PCS8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Zbtb40Q6PCS8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Zbtb40Q6PCS8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Zbtb40Q6PCS8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Zbtb40Q6PCS8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Zbtb40Q6PCS8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Zbtb40Q6PCS8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Zbtb40Q6PCS8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Zbtb40Q6PCS8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Zbtb40Q6PCS8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Zbtb40Q6PCS8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Zbtb40Q6PCS8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Zbtb40Q6PCS8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Zbtb40Q6PCS8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Zbtb40Q6PCS8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms