Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC62Q6P9F0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC62Q6P9F0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC62Q6P9F0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC62Q6P9F0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC62Q6P9F0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC62Q6P9F0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC62Q6P9F0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC62Q6P9F0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC62Q6P9F0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CCDC62Q6P9F0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC62Q6P9F0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC62Q6P9F0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC62Q6P9F0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC62Q6P9F0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC62Q6P9F0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC62Q6P9F0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC62Q6P9F0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC62Q6P9F0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC62Q6P9F0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCDC62Q6P9F0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC62Q6P9F0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC62Q6P9F0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC62Q6P9F0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC62Q6P9F0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC62Q6P9F0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC62Q6P9F0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC62Q6P9F0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC62Q6P9F0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC62Q6P9F0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC62Q6P9F0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC62Q6P9F0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC62Q6P9F0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC62Q6P9F0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC62Q6P9F0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC62Q6P9F0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC62Q6P9F0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC62Q6P9F0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC62Q6P9F0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC62Q6P9F0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC62Q6P9F0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC62Q6P9F0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC62Q6P9F0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC62Q6P9F0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC62Q6P9F0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC62Q6P9F0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC62Q6P9F0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC62Q6P9F0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC62Q6P9F0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC62Q6P9F0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC62Q6P9F0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC62Q6P9F0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC62Q6P9F0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC62Q6P9F0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC62Q6P9F0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC62Q6P9F0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC62Q6P9F0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC62Q6P9F0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC62Q6P9F0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC62Q6P9F0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC62Q6P9F0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC62Q6P9F0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC62Q6P9F0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC62Q6P9F0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC62Q6P9F0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC62Q6P9F0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC62Q6P9F0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC62Q6P9F0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC62Q6P9F0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC62Q6P9F0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC62Q6P9F0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC62Q6P9F0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC62Q6P9F0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC62Q6P9F0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC62Q6P9F0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC62Q6P9F0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC62Q6P9F0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC62Q6P9F0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC62Q6P9F0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC62Q6P9F0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC62Q6P9F0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC62Q6P9F0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC62Q6P9F0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC62Q6P9F0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC62Q6P9F0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC62Q6P9F0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC62Q6P9F0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC62Q6P9F0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC62Q6P9F0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC62Q6P9F0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC62Q6P9F0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC62Q6P9F0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC62Q6P9F0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC62Q6P9F0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC62Q6P9F0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC62Q6P9F0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC62Q6P9F0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC62Q6P9F0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC62Q6P9F0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC62Q6P9F0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms