Protein–RNA interactions for Protein: Q6P461

ACSM6, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM6Q6P461 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSM6Q6P461 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSM6Q6P461 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSM6Q6P461 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSM6Q6P461 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSM6Q6P461 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSM6Q6P461 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSM6Q6P461 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSM6Q6P461 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSM6Q6P461 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSM6Q6P461 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSM6Q6P461 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSM6Q6P461 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSM6Q6P461 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSM6Q6P461 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSM6Q6P461 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSM6Q6P461 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSM6Q6P461 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSM6Q6P461 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSM6Q6P461 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSM6Q6P461 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSM6Q6P461 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSM6Q6P461 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSM6Q6P461 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSM6Q6P461 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSM6Q6P461 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSM6Q6P461 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSM6Q6P461 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSM6Q6P461 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSM6Q6P461 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSM6Q6P461 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ACSM6Q6P461 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACSM6Q6P461 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACSM6Q6P461 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACSM6Q6P461 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACSM6Q6P461 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ACSM6Q6P461 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACSM6Q6P461 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACSM6Q6P461 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACSM6Q6P461 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACSM6Q6P461 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACSM6Q6P461 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACSM6Q6P461 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACSM6Q6P461 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACSM6Q6P461 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACSM6Q6P461 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACSM6Q6P461 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACSM6Q6P461 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACSM6Q6P461 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACSM6Q6P461 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACSM6Q6P461 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACSM6Q6P461 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACSM6Q6P461 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACSM6Q6P461 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ACSM6Q6P461 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ACSM6Q6P461 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSM6Q6P461 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSM6Q6P461 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSM6Q6P461 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACSM6Q6P461 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACSM6Q6P461 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACSM6Q6P461 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSM6Q6P461 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSM6Q6P461 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSM6Q6P461 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSM6Q6P461 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSM6Q6P461 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSM6Q6P461 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSM6Q6P461 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSM6Q6P461 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSM6Q6P461 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSM6Q6P461 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSM6Q6P461 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSM6Q6P461 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSM6Q6P461 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSM6Q6P461 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSM6Q6P461 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSM6Q6P461 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSM6Q6P461 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSM6Q6P461 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSM6Q6P461 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACSM6Q6P461 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACSM6Q6P461 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACSM6Q6P461 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACSM6Q6P461 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACSM6Q6P461 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACSM6Q6P461 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACSM6Q6P461 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACSM6Q6P461 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACSM6Q6P461 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACSM6Q6P461 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACSM6Q6P461 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACSM6Q6P461 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACSM6Q6P461 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACSM6Q6P461 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACSM6Q6P461 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACSM6Q6P461 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACSM6Q6P461 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACSM6Q6P461 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSM6Q6P461 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms