Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1A2

LPCAT3, Lysophospholipid acyltransferase 5, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT3Q6P1A2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPCAT3Q6P1A2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPCAT3Q6P1A2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPCAT3Q6P1A2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT3Q6P1A2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT3Q6P1A2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT3Q6P1A2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPCAT3Q6P1A2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPCAT3Q6P1A2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPCAT3Q6P1A2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPCAT3Q6P1A2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPCAT3Q6P1A2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPCAT3Q6P1A2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPCAT3Q6P1A2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPCAT3Q6P1A2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPCAT3Q6P1A2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPCAT3Q6P1A2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPCAT3Q6P1A2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPCAT3Q6P1A2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPCAT3Q6P1A2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPCAT3Q6P1A2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPCAT3Q6P1A2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPCAT3Q6P1A2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPCAT3Q6P1A2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPCAT3Q6P1A2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LPCAT3Q6P1A2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LPCAT3Q6P1A2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LPCAT3Q6P1A2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPCAT3Q6P1A2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPCAT3Q6P1A2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPCAT3Q6P1A2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPCAT3Q6P1A2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPCAT3Q6P1A2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPCAT3Q6P1A2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPCAT3Q6P1A2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPCAT3Q6P1A2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPCAT3Q6P1A2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPCAT3Q6P1A2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPCAT3Q6P1A2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPCAT3Q6P1A2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPCAT3Q6P1A2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPCAT3Q6P1A2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPCAT3Q6P1A2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPCAT3Q6P1A2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPCAT3Q6P1A2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPCAT3Q6P1A2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPCAT3Q6P1A2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPCAT3Q6P1A2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPCAT3Q6P1A2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPCAT3Q6P1A2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LPCAT3Q6P1A2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPCAT3Q6P1A2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPCAT3Q6P1A2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPCAT3Q6P1A2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPCAT3Q6P1A2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPCAT3Q6P1A2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPCAT3Q6P1A2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPCAT3Q6P1A2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPCAT3Q6P1A2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPCAT3Q6P1A2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPCAT3Q6P1A2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LPCAT3Q6P1A2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPCAT3Q6P1A2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPCAT3Q6P1A2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPCAT3Q6P1A2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPCAT3Q6P1A2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPCAT3Q6P1A2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPCAT3Q6P1A2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPCAT3Q6P1A2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LPCAT3Q6P1A2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPCAT3Q6P1A2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPCAT3Q6P1A2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPCAT3Q6P1A2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPCAT3Q6P1A2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPCAT3Q6P1A2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPCAT3Q6P1A2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPCAT3Q6P1A2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPCAT3Q6P1A2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPCAT3Q6P1A2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPCAT3Q6P1A2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LPCAT3Q6P1A2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPCAT3Q6P1A2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPCAT3Q6P1A2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPCAT3Q6P1A2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPCAT3Q6P1A2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LPCAT3Q6P1A2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPCAT3Q6P1A2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPCAT3Q6P1A2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPCAT3Q6P1A2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPCAT3Q6P1A2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPCAT3Q6P1A2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPCAT3Q6P1A2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPCAT3Q6P1A2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPCAT3Q6P1A2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPCAT3Q6P1A2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPCAT3Q6P1A2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPCAT3Q6P1A2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPCAT3Q6P1A2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPCAT3Q6P1A2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPCAT3Q6P1A2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms