Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
CAVIN1Q6NZI2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CAVIN1Q6NZI2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CAVIN1Q6NZI2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CAVIN1Q6NZI2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CAVIN1Q6NZI2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CAVIN1Q6NZI2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CAVIN1Q6NZI2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CAVIN1Q6NZI2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CAVIN1Q6NZI2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CAVIN1Q6NZI2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CAVIN1Q6NZI2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CAVIN1Q6NZI2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CAVIN1Q6NZI2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CAVIN1Q6NZI2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CAVIN1Q6NZI2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CAVIN1Q6NZI2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CAVIN1Q6NZI2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CAVIN1Q6NZI2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CAVIN1Q6NZI2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CAVIN1Q6NZI2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CAVIN1Q6NZI2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
CAVIN1Q6NZI2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CAVIN1Q6NZI2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CAVIN1Q6NZI2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CAVIN1Q6NZI2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CAVIN1Q6NZI2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CAVIN1Q6NZI2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CAVIN1Q6NZI2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CAVIN1Q6NZI2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CAVIN1Q6NZI2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CAVIN1Q6NZI2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CAVIN1Q6NZI2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CAVIN1Q6NZI2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CAVIN1Q6NZI2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CAVIN1Q6NZI2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CAVIN1Q6NZI2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CAVIN1Q6NZI2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CAVIN1Q6NZI2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CAVIN1Q6NZI2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CAVIN1Q6NZI2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CAVIN1Q6NZI2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CAVIN1Q6NZI2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CAVIN1Q6NZI2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CAVIN1Q6NZI2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CAVIN1Q6NZI2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CAVIN1Q6NZI2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CAVIN1Q6NZI2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CAVIN1Q6NZI2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CAVIN1Q6NZI2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CAVIN1Q6NZI2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CAVIN1Q6NZI2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CAVIN1Q6NZI2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CAVIN1Q6NZI2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CAVIN1Q6NZI2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CAVIN1Q6NZI2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CAVIN1Q6NZI2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CAVIN1Q6NZI2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CAVIN1Q6NZI2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CAVIN1Q6NZI2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CAVIN1Q6NZI2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CAVIN1Q6NZI2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CAVIN1Q6NZI2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CAVIN1Q6NZI2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CAVIN1Q6NZI2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CAVIN1Q6NZI2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CAVIN1Q6NZI2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
CAVIN1Q6NZI2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CAVIN1Q6NZI2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CAVIN1Q6NZI2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CAVIN1Q6NZI2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CAVIN1Q6NZI2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CAVIN1Q6NZI2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
CAVIN1Q6NZI2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CAVIN1Q6NZI2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CAVIN1Q6NZI2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
CAVIN1Q6NZI2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CAVIN1Q6NZI2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CAVIN1Q6NZI2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CAVIN1Q6NZI2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CAVIN1Q6NZI2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CAVIN1Q6NZI2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CAVIN1Q6NZI2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CAVIN1Q6NZI2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CAVIN1Q6NZI2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CAVIN1Q6NZI2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CAVIN1Q6NZI2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CAVIN1Q6NZI2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CAVIN1Q6NZI2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CAVIN1Q6NZI2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CAVIN1Q6NZI2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CAVIN1Q6NZI2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CAVIN1Q6NZI2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CAVIN1Q6NZI2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CAVIN1Q6NZI2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CAVIN1Q6NZI2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CAVIN1Q6NZI2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CAVIN1Q6NZI2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CAVIN1Q6NZI2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CAVIN1Q6NZI2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms