Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3F3CQ6NXT2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3F3CQ6NXT2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3F3CQ6NXT2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H3F3CQ6NXT2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H3F3CQ6NXT2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3F3CQ6NXT2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3F3CQ6NXT2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3F3CQ6NXT2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3F3CQ6NXT2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3F3CQ6NXT2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3F3CQ6NXT2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3F3CQ6NXT2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H3F3CQ6NXT2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
H3F3CQ6NXT2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
H3F3CQ6NXT2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
H3F3CQ6NXT2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H3F3CQ6NXT2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H3F3CQ6NXT2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
H3F3CQ6NXT2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
H3F3CQ6NXT2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3F3CQ6NXT2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3F3CQ6NXT2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3F3CQ6NXT2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3F3CQ6NXT2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3F3CQ6NXT2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3F3CQ6NXT2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3F3CQ6NXT2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3F3CQ6NXT2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
H3F3CQ6NXT2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
H3F3CQ6NXT2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
H3F3CQ6NXT2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
H3F3CQ6NXT2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
H3F3CQ6NXT2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
H3F3CQ6NXT2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
H3F3CQ6NXT2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
H3F3CQ6NXT2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
H3F3CQ6NXT2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H3F3CQ6NXT2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
H3F3CQ6NXT2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3F3CQ6NXT2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
H3F3CQ6NXT2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3F3CQ6NXT2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3F3CQ6NXT2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
H3F3CQ6NXT2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
H3F3CQ6NXT2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
H3F3CQ6NXT2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3F3CQ6NXT2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3F3CQ6NXT2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3F3CQ6NXT2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
H3F3CQ6NXT2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
H3F3CQ6NXT2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H3F3CQ6NXT2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
H3F3CQ6NXT2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
H3F3CQ6NXT2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H3F3CQ6NXT2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H3F3CQ6NXT2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3F3CQ6NXT2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3F3CQ6NXT2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
H3F3CQ6NXT2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H3F3CQ6NXT2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3F3CQ6NXT2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3F3CQ6NXT2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3F3CQ6NXT2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3F3CQ6NXT2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
H3F3CQ6NXT2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3F3CQ6NXT2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
H3F3CQ6NXT2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3F3CQ6NXT2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3F3CQ6NXT2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3F3CQ6NXT2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3F3CQ6NXT2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3F3CQ6NXT2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3F3CQ6NXT2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3F3CQ6NXT2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3F3CQ6NXT2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3F3CQ6NXT2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3F3CQ6NXT2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3F3CQ6NXT2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3F3CQ6NXT2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3F3CQ6NXT2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3F3CQ6NXT2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3F3CQ6NXT2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3F3CQ6NXT2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3F3CQ6NXT2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3F3CQ6NXT2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3F3CQ6NXT2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3F3CQ6NXT2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3F3CQ6NXT2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3F3CQ6NXT2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3F3CQ6NXT2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3F3CQ6NXT2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
H3F3CQ6NXT2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
H3F3CQ6NXT2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
H3F3CQ6NXT2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3F3CQ6NXT2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3F3CQ6NXT2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3F3CQ6NXT2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3F3CQ6NXT2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3F3CQ6NXT2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms