Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE5

LCN12, Epididymal-specific lipocalin-12, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN12Q6JVE5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LCN12Q6JVE5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LCN12Q6JVE5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LCN12Q6JVE5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LCN12Q6JVE5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LCN12Q6JVE5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LCN12Q6JVE5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LCN12Q6JVE5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LCN12Q6JVE5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LCN12Q6JVE5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LCN12Q6JVE5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LCN12Q6JVE5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LCN12Q6JVE5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LCN12Q6JVE5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LCN12Q6JVE5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LCN12Q6JVE5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LCN12Q6JVE5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LCN12Q6JVE5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LCN12Q6JVE5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LCN12Q6JVE5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LCN12Q6JVE5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LCN12Q6JVE5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCN12Q6JVE5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCN12Q6JVE5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCN12Q6JVE5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCN12Q6JVE5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCN12Q6JVE5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCN12Q6JVE5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCN12Q6JVE5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCN12Q6JVE5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCN12Q6JVE5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCN12Q6JVE5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCN12Q6JVE5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LCN12Q6JVE5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LCN12Q6JVE5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LCN12Q6JVE5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCN12Q6JVE5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LCN12Q6JVE5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCN12Q6JVE5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCN12Q6JVE5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCN12Q6JVE5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LCN12Q6JVE5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LCN12Q6JVE5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LCN12Q6JVE5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LCN12Q6JVE5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LCN12Q6JVE5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LCN12Q6JVE5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LCN12Q6JVE5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
LCN12Q6JVE5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LCN12Q6JVE5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LCN12Q6JVE5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LCN12Q6JVE5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LCN12Q6JVE5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LCN12Q6JVE5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LCN12Q6JVE5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LCN12Q6JVE5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LCN12Q6JVE5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LCN12Q6JVE5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LCN12Q6JVE5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LCN12Q6JVE5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LCN12Q6JVE5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LCN12Q6JVE5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LCN12Q6JVE5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LCN12Q6JVE5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LCN12Q6JVE5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LCN12Q6JVE5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LCN12Q6JVE5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LCN12Q6JVE5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LCN12Q6JVE5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LCN12Q6JVE5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LCN12Q6JVE5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LCN12Q6JVE5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LCN12Q6JVE5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LCN12Q6JVE5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LCN12Q6JVE5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LCN12Q6JVE5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LCN12Q6JVE5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LCN12Q6JVE5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LCN12Q6JVE5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LCN12Q6JVE5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LCN12Q6JVE5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LCN12Q6JVE5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LCN12Q6JVE5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LCN12Q6JVE5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LCN12Q6JVE5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LCN12Q6JVE5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LCN12Q6JVE5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LCN12Q6JVE5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LCN12Q6JVE5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LCN12Q6JVE5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LCN12Q6JVE5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LCN12Q6JVE5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LCN12Q6JVE5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LCN12Q6JVE5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LCN12Q6JVE5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LCN12Q6JVE5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LCN12Q6JVE5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LCN12Q6JVE5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LCN12Q6JVE5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LCN12Q6JVE5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms