Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CENPPQ6IPU0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CENPPQ6IPU0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CENPPQ6IPU0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CENPPQ6IPU0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CENPPQ6IPU0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CENPPQ6IPU0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CENPPQ6IPU0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CENPPQ6IPU0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CENPPQ6IPU0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CENPPQ6IPU0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CENPPQ6IPU0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CENPPQ6IPU0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CENPPQ6IPU0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CENPPQ6IPU0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CENPPQ6IPU0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CENPPQ6IPU0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CENPPQ6IPU0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CENPPQ6IPU0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CENPPQ6IPU0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CENPPQ6IPU0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CENPPQ6IPU0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CENPPQ6IPU0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CENPPQ6IPU0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CENPPQ6IPU0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CENPPQ6IPU0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CENPPQ6IPU0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CENPPQ6IPU0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CENPPQ6IPU0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CENPPQ6IPU0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CENPPQ6IPU0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CENPPQ6IPU0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CENPPQ6IPU0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CENPPQ6IPU0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CENPPQ6IPU0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CENPPQ6IPU0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CENPPQ6IPU0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CENPPQ6IPU0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CENPPQ6IPU0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CENPPQ6IPU0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CENPPQ6IPU0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CENPPQ6IPU0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CENPPQ6IPU0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CENPPQ6IPU0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CENPPQ6IPU0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CENPPQ6IPU0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CENPPQ6IPU0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CENPPQ6IPU0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CENPPQ6IPU0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CENPPQ6IPU0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CENPPQ6IPU0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CENPPQ6IPU0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CENPPQ6IPU0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CENPPQ6IPU0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CENPPQ6IPU0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CENPPQ6IPU0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CENPPQ6IPU0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CENPPQ6IPU0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CENPPQ6IPU0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CENPPQ6IPU0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CENPPQ6IPU0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CENPPQ6IPU0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CENPPQ6IPU0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CENPPQ6IPU0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CENPPQ6IPU0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CENPPQ6IPU0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CENPPQ6IPU0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CENPPQ6IPU0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CENPPQ6IPU0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CENPPQ6IPU0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CENPPQ6IPU0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CENPPQ6IPU0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CENPPQ6IPU0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CENPPQ6IPU0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CENPPQ6IPU0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CENPPQ6IPU0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CENPPQ6IPU0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CENPPQ6IPU0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CENPPQ6IPU0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CENPPQ6IPU0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CENPPQ6IPU0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CENPPQ6IPU0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CENPPQ6IPU0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CENPPQ6IPU0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CENPPQ6IPU0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CENPPQ6IPU0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CENPPQ6IPU0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CENPPQ6IPU0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CENPPQ6IPU0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CENPPQ6IPU0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CENPPQ6IPU0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CENPPQ6IPU0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CENPPQ6IPU0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CENPPQ6IPU0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CENPPQ6IPU0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CENPPQ6IPU0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CENPPQ6IPU0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CENPPQ6IPU0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CENPPQ6IPU0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CENPPQ6IPU0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms