Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRAMD4Q6IC98 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRAMD4Q6IC98 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRAMD4Q6IC98 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRAMD4Q6IC98 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRAMD4Q6IC98 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRAMD4Q6IC98 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRAMD4Q6IC98 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GRAMD4Q6IC98 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRAMD4Q6IC98 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRAMD4Q6IC98 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRAMD4Q6IC98 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GRAMD4Q6IC98 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRAMD4Q6IC98 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRAMD4Q6IC98 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GRAMD4Q6IC98 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRAMD4Q6IC98 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRAMD4Q6IC98 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRAMD4Q6IC98 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRAMD4Q6IC98 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRAMD4Q6IC98 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRAMD4Q6IC98 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRAMD4Q6IC98 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GRAMD4Q6IC98 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRAMD4Q6IC98 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRAMD4Q6IC98 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRAMD4Q6IC98 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRAMD4Q6IC98 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRAMD4Q6IC98 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRAMD4Q6IC98 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRAMD4Q6IC98 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GRAMD4Q6IC98 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRAMD4Q6IC98 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRAMD4Q6IC98 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRAMD4Q6IC98 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRAMD4Q6IC98 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRAMD4Q6IC98 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRAMD4Q6IC98 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRAMD4Q6IC98 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRAMD4Q6IC98 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRAMD4Q6IC98 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRAMD4Q6IC98 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
GRAMD4Q6IC98 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRAMD4Q6IC98 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRAMD4Q6IC98 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRAMD4Q6IC98 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRAMD4Q6IC98 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRAMD4Q6IC98 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRAMD4Q6IC98 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRAMD4Q6IC98 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GRAMD4Q6IC98 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GRAMD4Q6IC98 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GRAMD4Q6IC98 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GRAMD4Q6IC98 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GRAMD4Q6IC98 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GRAMD4Q6IC98 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRAMD4Q6IC98 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRAMD4Q6IC98 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRAMD4Q6IC98 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRAMD4Q6IC98 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GRAMD4Q6IC98 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRAMD4Q6IC98 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRAMD4Q6IC98 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRAMD4Q6IC98 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRAMD4Q6IC98 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRAMD4Q6IC98 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
GRAMD4Q6IC98 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRAMD4Q6IC98 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRAMD4Q6IC98 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRAMD4Q6IC98 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRAMD4Q6IC98 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRAMD4Q6IC98 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRAMD4Q6IC98 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRAMD4Q6IC98 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRAMD4Q6IC98 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRAMD4Q6IC98 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRAMD4Q6IC98 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRAMD4Q6IC98 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRAMD4Q6IC98 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRAMD4Q6IC98 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRAMD4Q6IC98 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRAMD4Q6IC98 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRAMD4Q6IC98 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRAMD4Q6IC98 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GRAMD4Q6IC98 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GRAMD4Q6IC98 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GRAMD4Q6IC98 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GRAMD4Q6IC98 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRAMD4Q6IC98 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRAMD4Q6IC98 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRAMD4Q6IC98 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRAMD4Q6IC98 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRAMD4Q6IC98 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRAMD4Q6IC98 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRAMD4Q6IC98 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRAMD4Q6IC98 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRAMD4Q6IC98 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GRAMD4Q6IC98 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRAMD4Q6IC98 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRAMD4Q6IC98 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.1 ms