Protein–RNA interactions for Protein: Q6FHJ7

SFRP4, Secreted frizzled-related protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4Q6FHJ7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFRP4Q6FHJ7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFRP4Q6FHJ7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFRP4Q6FHJ7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFRP4Q6FHJ7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFRP4Q6FHJ7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFRP4Q6FHJ7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFRP4Q6FHJ7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFRP4Q6FHJ7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFRP4Q6FHJ7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFRP4Q6FHJ7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFRP4Q6FHJ7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFRP4Q6FHJ7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFRP4Q6FHJ7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFRP4Q6FHJ7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFRP4Q6FHJ7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFRP4Q6FHJ7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFRP4Q6FHJ7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFRP4Q6FHJ7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFRP4Q6FHJ7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFRP4Q6FHJ7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFRP4Q6FHJ7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFRP4Q6FHJ7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SFRP4Q6FHJ7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFRP4Q6FHJ7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFRP4Q6FHJ7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFRP4Q6FHJ7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFRP4Q6FHJ7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFRP4Q6FHJ7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFRP4Q6FHJ7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFRP4Q6FHJ7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFRP4Q6FHJ7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFRP4Q6FHJ7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFRP4Q6FHJ7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFRP4Q6FHJ7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFRP4Q6FHJ7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFRP4Q6FHJ7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFRP4Q6FHJ7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFRP4Q6FHJ7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFRP4Q6FHJ7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFRP4Q6FHJ7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFRP4Q6FHJ7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFRP4Q6FHJ7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFRP4Q6FHJ7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFRP4Q6FHJ7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFRP4Q6FHJ7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFRP4Q6FHJ7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFRP4Q6FHJ7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFRP4Q6FHJ7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFRP4Q6FHJ7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFRP4Q6FHJ7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFRP4Q6FHJ7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFRP4Q6FHJ7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFRP4Q6FHJ7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SFRP4Q6FHJ7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFRP4Q6FHJ7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFRP4Q6FHJ7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SFRP4Q6FHJ7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFRP4Q6FHJ7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SFRP4Q6FHJ7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SFRP4Q6FHJ7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SFRP4Q6FHJ7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SFRP4Q6FHJ7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SFRP4Q6FHJ7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFRP4Q6FHJ7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFRP4Q6FHJ7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFRP4Q6FHJ7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFRP4Q6FHJ7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFRP4Q6FHJ7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFRP4Q6FHJ7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SFRP4Q6FHJ7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SFRP4Q6FHJ7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFRP4Q6FHJ7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFRP4Q6FHJ7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFRP4Q6FHJ7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFRP4Q6FHJ7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFRP4Q6FHJ7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFRP4Q6FHJ7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFRP4Q6FHJ7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFRP4Q6FHJ7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFRP4Q6FHJ7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFRP4Q6FHJ7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFRP4Q6FHJ7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFRP4Q6FHJ7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFRP4Q6FHJ7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFRP4Q6FHJ7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFRP4Q6FHJ7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFRP4Q6FHJ7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFRP4Q6FHJ7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFRP4Q6FHJ7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFRP4Q6FHJ7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFRP4Q6FHJ7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFRP4Q6FHJ7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFRP4Q6FHJ7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFRP4Q6FHJ7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFRP4Q6FHJ7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFRP4Q6FHJ7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFRP4Q6FHJ7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SFRP4Q6FHJ7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFRP4Q6FHJ7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms