Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Nop58Q6DFW4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Nop58Q6DFW4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Nop58Q6DFW4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Nop58Q6DFW4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Nop58Q6DFW4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Nop58Q6DFW4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Nop58Q6DFW4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Nop58Q6DFW4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Nop58Q6DFW4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Nop58Q6DFW4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Nop58Q6DFW4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Nop58Q6DFW4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Nop58Q6DFW4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Nop58Q6DFW4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Nop58Q6DFW4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Nop58Q6DFW4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Nop58Q6DFW4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Nop58Q6DFW4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Nop58Q6DFW4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Nop58Q6DFW4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Nop58Q6DFW4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Nop58Q6DFW4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Nop58Q6DFW4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Nop58Q6DFW4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Nop58Q6DFW4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Nop58Q6DFW4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Nop58Q6DFW4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Nop58Q6DFW4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Nop58Q6DFW4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Nop58Q6DFW4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Nop58Q6DFW4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Nop58Q6DFW4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Nop58Q6DFW4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Nop58Q6DFW4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Nop58Q6DFW4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Nop58Q6DFW4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Nop58Q6DFW4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Nop58Q6DFW4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Nop58Q6DFW4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Nop58Q6DFW4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Nop58Q6DFW4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Nop58Q6DFW4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Nop58Q6DFW4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Nop58Q6DFW4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Nop58Q6DFW4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Nop58Q6DFW4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Nop58Q6DFW4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Nop58Q6DFW4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Nop58Q6DFW4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Nop58Q6DFW4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Nop58Q6DFW4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Nop58Q6DFW4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Nop58Q6DFW4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Nop58Q6DFW4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Nop58Q6DFW4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Nop58Q6DFW4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Nop58Q6DFW4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Nop58Q6DFW4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Nop58Q6DFW4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Nop58Q6DFW4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Nop58Q6DFW4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Nop58Q6DFW4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Nop58Q6DFW4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Nop58Q6DFW4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Nop58Q6DFW4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Nop58Q6DFW4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Nop58Q6DFW4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Nop58Q6DFW4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Nop58Q6DFW4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Nop58Q6DFW4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Nop58Q6DFW4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Nop58Q6DFW4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Nop58Q6DFW4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Nop58Q6DFW4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Nop58Q6DFW4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Nop58Q6DFW4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Nop58Q6DFW4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Nop58Q6DFW4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Nop58Q6DFW4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Nop58Q6DFW4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Nop58Q6DFW4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Nop58Q6DFW4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Nop58Q6DFW4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Nop58Q6DFW4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Nop58Q6DFW4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Nop58Q6DFW4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Nop58Q6DFW4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Nop58Q6DFW4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Nop58Q6DFW4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Nop58Q6DFW4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Nop58Q6DFW4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Nop58Q6DFW4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Nop58Q6DFW4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Nop58Q6DFW4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Nop58Q6DFW4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Nop58Q6DFW4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Nop58Q6DFW4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Nop58Q6DFW4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Nop58Q6DFW4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms