Protein–RNA interactions for Protein: Q69YZ2

TMEM200B, Transmembrane protein 200B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200BQ69YZ2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM200BQ69YZ2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM200BQ69YZ2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM200BQ69YZ2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM200BQ69YZ2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM200BQ69YZ2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM200BQ69YZ2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM200BQ69YZ2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM200BQ69YZ2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM200BQ69YZ2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM200BQ69YZ2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM200BQ69YZ2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM200BQ69YZ2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM200BQ69YZ2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM200BQ69YZ2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM200BQ69YZ2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM200BQ69YZ2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM200BQ69YZ2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM200BQ69YZ2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM200BQ69YZ2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM200BQ69YZ2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMEM200BQ69YZ2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM200BQ69YZ2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM200BQ69YZ2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM200BQ69YZ2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM200BQ69YZ2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM200BQ69YZ2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM200BQ69YZ2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM200BQ69YZ2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM200BQ69YZ2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM200BQ69YZ2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM200BQ69YZ2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM200BQ69YZ2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMEM200BQ69YZ2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM200BQ69YZ2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM200BQ69YZ2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM200BQ69YZ2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM200BQ69YZ2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM200BQ69YZ2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM200BQ69YZ2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM200BQ69YZ2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM200BQ69YZ2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM200BQ69YZ2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM200BQ69YZ2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM200BQ69YZ2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM200BQ69YZ2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM200BQ69YZ2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM200BQ69YZ2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM200BQ69YZ2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM200BQ69YZ2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM200BQ69YZ2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM200BQ69YZ2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM200BQ69YZ2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM200BQ69YZ2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM200BQ69YZ2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM200BQ69YZ2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM200BQ69YZ2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM200BQ69YZ2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM200BQ69YZ2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM200BQ69YZ2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM200BQ69YZ2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM200BQ69YZ2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM200BQ69YZ2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM200BQ69YZ2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM200BQ69YZ2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM200BQ69YZ2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM200BQ69YZ2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM200BQ69YZ2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM200BQ69YZ2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM200BQ69YZ2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM200BQ69YZ2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM200BQ69YZ2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM200BQ69YZ2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM200BQ69YZ2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM200BQ69YZ2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM200BQ69YZ2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM200BQ69YZ2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM200BQ69YZ2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM200BQ69YZ2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM200BQ69YZ2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM200BQ69YZ2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM200BQ69YZ2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM200BQ69YZ2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM200BQ69YZ2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM200BQ69YZ2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM200BQ69YZ2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM200BQ69YZ2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
TMEM200BQ69YZ2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM200BQ69YZ2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM200BQ69YZ2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM200BQ69YZ2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM200BQ69YZ2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM200BQ69YZ2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM200BQ69YZ2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM200BQ69YZ2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM200BQ69YZ2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM200BQ69YZ2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM200BQ69YZ2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM200BQ69YZ2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM200BQ69YZ2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms