Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG16L1Q676U5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG16L1Q676U5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG16L1Q676U5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG16L1Q676U5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG16L1Q676U5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG16L1Q676U5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG16L1Q676U5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG16L1Q676U5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG16L1Q676U5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG16L1Q676U5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG16L1Q676U5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG16L1Q676U5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG16L1Q676U5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG16L1Q676U5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG16L1Q676U5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG16L1Q676U5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG16L1Q676U5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATG16L1Q676U5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ATG16L1Q676U5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATG16L1Q676U5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATG16L1Q676U5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATG16L1Q676U5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG16L1Q676U5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG16L1Q676U5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG16L1Q676U5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG16L1Q676U5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG16L1Q676U5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG16L1Q676U5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG16L1Q676U5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG16L1Q676U5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG16L1Q676U5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG16L1Q676U5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG16L1Q676U5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG16L1Q676U5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG16L1Q676U5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG16L1Q676U5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG16L1Q676U5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATG16L1Q676U5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATG16L1Q676U5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATG16L1Q676U5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATG16L1Q676U5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATG16L1Q676U5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATG16L1Q676U5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATG16L1Q676U5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATG16L1Q676U5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATG16L1Q676U5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATG16L1Q676U5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG16L1Q676U5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG16L1Q676U5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG16L1Q676U5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG16L1Q676U5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG16L1Q676U5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATG16L1Q676U5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATG16L1Q676U5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATG16L1Q676U5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATG16L1Q676U5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG16L1Q676U5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG16L1Q676U5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATG16L1Q676U5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATG16L1Q676U5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATG16L1Q676U5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATG16L1Q676U5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATG16L1Q676U5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATG16L1Q676U5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATG16L1Q676U5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATG16L1Q676U5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATG16L1Q676U5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATG16L1Q676U5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ATG16L1Q676U5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATG16L1Q676U5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATG16L1Q676U5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATG16L1Q676U5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATG16L1Q676U5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATG16L1Q676U5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATG16L1Q676U5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATG16L1Q676U5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATG16L1Q676U5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ATG16L1Q676U5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATG16L1Q676U5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATG16L1Q676U5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATG16L1Q676U5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATG16L1Q676U5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATG16L1Q676U5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATG16L1Q676U5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATG16L1Q676U5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATG16L1Q676U5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATG16L1Q676U5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATG16L1Q676U5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATG16L1Q676U5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATG16L1Q676U5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATG16L1Q676U5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ATG16L1Q676U5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG16L1Q676U5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG16L1Q676U5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG16L1Q676U5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATG16L1Q676U5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG16L1Q676U5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG16L1Q676U5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATG16L1Q676U5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms