Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ino80dQ66JY2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ino80dQ66JY2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ino80dQ66JY2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ino80dQ66JY2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ino80dQ66JY2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ino80dQ66JY2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ino80dQ66JY2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ino80dQ66JY2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ino80dQ66JY2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ino80dQ66JY2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ino80dQ66JY2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ino80dQ66JY2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ino80dQ66JY2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ino80dQ66JY2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ino80dQ66JY2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ino80dQ66JY2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ino80dQ66JY2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ino80dQ66JY2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ino80dQ66JY2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ino80dQ66JY2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ino80dQ66JY2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ino80dQ66JY2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ino80dQ66JY2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ino80dQ66JY2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ino80dQ66JY2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ino80dQ66JY2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ino80dQ66JY2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ino80dQ66JY2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ino80dQ66JY2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ino80dQ66JY2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ino80dQ66JY2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ino80dQ66JY2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ino80dQ66JY2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ino80dQ66JY2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ino80dQ66JY2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ino80dQ66JY2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ino80dQ66JY2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ino80dQ66JY2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ino80dQ66JY2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ino80dQ66JY2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ino80dQ66JY2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ino80dQ66JY2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ino80dQ66JY2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ino80dQ66JY2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ino80dQ66JY2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ino80dQ66JY2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ino80dQ66JY2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ino80dQ66JY2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ino80dQ66JY2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ino80dQ66JY2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ino80dQ66JY2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ino80dQ66JY2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ino80dQ66JY2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ino80dQ66JY2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ino80dQ66JY2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ino80dQ66JY2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ino80dQ66JY2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ino80dQ66JY2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ino80dQ66JY2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ino80dQ66JY2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ino80dQ66JY2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ino80dQ66JY2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ino80dQ66JY2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ino80dQ66JY2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ino80dQ66JY2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ino80dQ66JY2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ino80dQ66JY2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ino80dQ66JY2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ino80dQ66JY2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ino80dQ66JY2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ino80dQ66JY2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ino80dQ66JY2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ino80dQ66JY2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ino80dQ66JY2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ino80dQ66JY2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ino80dQ66JY2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ino80dQ66JY2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ino80dQ66JY2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ino80dQ66JY2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ino80dQ66JY2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ino80dQ66JY2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ino80dQ66JY2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ino80dQ66JY2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ino80dQ66JY2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ino80dQ66JY2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ino80dQ66JY2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ino80dQ66JY2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ino80dQ66JY2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ino80dQ66JY2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ino80dQ66JY2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ino80dQ66JY2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ino80dQ66JY2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ino80dQ66JY2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ino80dQ66JY2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ino80dQ66JY2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ino80dQ66JY2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ino80dQ66JY2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ino80dQ66JY2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ino80dQ66JY2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms