Protein–RNA interactions for Protein: Q64691

Capn3, Calpain-3, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn3Q64691 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Capn3Q64691 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Capn3Q64691 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Capn3Q64691 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Capn3Q64691 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Capn3Q64691 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Capn3Q64691 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Capn3Q64691 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Capn3Q64691 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Capn3Q64691 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Capn3Q64691 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Capn3Q64691 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Capn3Q64691 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Capn3Q64691 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Capn3Q64691 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Capn3Q64691 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Capn3Q64691 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Capn3Q64691 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Capn3Q64691 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Capn3Q64691 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Capn3Q64691 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Capn3Q64691 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Capn3Q64691 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Capn3Q64691 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Capn3Q64691 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Capn3Q64691 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Capn3Q64691 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Capn3Q64691 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Capn3Q64691 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Capn3Q64691 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Capn3Q64691 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Capn3Q64691 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Capn3Q64691 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Capn3Q64691 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Capn3Q64691 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Capn3Q64691 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Capn3Q64691 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Capn3Q64691 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Capn3Q64691 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Capn3Q64691 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Capn3Q64691 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Capn3Q64691 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Capn3Q64691 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Capn3Q64691 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Capn3Q64691 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Capn3Q64691 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Capn3Q64691 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Capn3Q64691 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Capn3Q64691 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Capn3Q64691 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Capn3Q64691 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Capn3Q64691 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Capn3Q64691 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Capn3Q64691 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Capn3Q64691 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Capn3Q64691 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Capn3Q64691 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Capn3Q64691 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Capn3Q64691 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Capn3Q64691 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Capn3Q64691 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Capn3Q64691 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Capn3Q64691 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Capn3Q64691 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Capn3Q64691 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Capn3Q64691 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Capn3Q64691 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Capn3Q64691 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Capn3Q64691 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Capn3Q64691 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Capn3Q64691 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Capn3Q64691 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Capn3Q64691 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Capn3Q64691 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Capn3Q64691 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Capn3Q64691 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Capn3Q64691 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capn3Q64691 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capn3Q64691 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Capn3Q64691 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Capn3Q64691 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Capn3Q64691 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Capn3Q64691 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Capn3Q64691 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Capn3Q64691 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Capn3Q64691 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Capn3Q64691 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capn3Q64691 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capn3Q64691 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capn3Q64691 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Capn3Q64691 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Capn3Q64691 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Capn3Q64691 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Capn3Q64691 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Capn3Q64691 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Capn3Q64691 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Capn3Q64691 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Capn3Q64691 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Capn3Q64691 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capn3Q64691 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms