Protein–RNA interactions for Protein: Q64322

Npdc1, Neural proliferation differentiation and control protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npdc1Q64322 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Npdc1Q64322 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Npdc1Q64322 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Npdc1Q64322 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npdc1Q64322 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npdc1Q64322 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Npdc1Q64322 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Npdc1Q64322 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npdc1Q64322 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npdc1Q64322 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npdc1Q64322 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npdc1Q64322 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Npdc1Q64322 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Npdc1Q64322 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Npdc1Q64322 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Npdc1Q64322 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Npdc1Q64322 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Npdc1Q64322 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Npdc1Q64322 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Npdc1Q64322 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Npdc1Q64322 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Npdc1Q64322 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Npdc1Q64322 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Npdc1Q64322 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Npdc1Q64322 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Npdc1Q64322 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Npdc1Q64322 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Npdc1Q64322 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Npdc1Q64322 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Npdc1Q64322 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Npdc1Q64322 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Npdc1Q64322 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Npdc1Q64322 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Npdc1Q64322 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Npdc1Q64322 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Npdc1Q64322 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npdc1Q64322 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npdc1Q64322 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npdc1Q64322 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npdc1Q64322 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npdc1Q64322 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npdc1Q64322 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npdc1Q64322 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Npdc1Q64322 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Npdc1Q64322 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Npdc1Q64322 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Npdc1Q64322 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Npdc1Q64322 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Npdc1Q64322 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Npdc1Q64322 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npdc1Q64322 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Npdc1Q64322 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npdc1Q64322 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npdc1Q64322 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npdc1Q64322 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npdc1Q64322 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npdc1Q64322 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npdc1Q64322 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npdc1Q64322 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npdc1Q64322 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npdc1Q64322 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npdc1Q64322 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npdc1Q64322 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npdc1Q64322 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npdc1Q64322 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npdc1Q64322 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npdc1Q64322 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Npdc1Q64322 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Npdc1Q64322 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Npdc1Q64322 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Npdc1Q64322 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Npdc1Q64322 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Npdc1Q64322 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Npdc1Q64322 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Npdc1Q64322 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Npdc1Q64322 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Npdc1Q64322 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Npdc1Q64322 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Npdc1Q64322 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Npdc1Q64322 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Npdc1Q64322 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Npdc1Q64322 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Npdc1Q64322 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Npdc1Q64322 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Npdc1Q64322 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Npdc1Q64322 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Npdc1Q64322 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Npdc1Q64322 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Npdc1Q64322 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Npdc1Q64322 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Npdc1Q64322 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Npdc1Q64322 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Npdc1Q64322 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Npdc1Q64322 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Npdc1Q64322 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Npdc1Q64322 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Npdc1Q64322 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Npdc1Q64322 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Npdc1Q64322 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Npdc1Q64322 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms