Protein–RNA interactions for Protein: Q62481

Vps72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps72Q62481 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Vps72Q62481 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vps72Q62481 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vps72Q62481 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vps72Q62481 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vps72Q62481 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vps72Q62481 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vps72Q62481 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Vps72Q62481 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Vps72Q62481 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Vps72Q62481 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vps72Q62481 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vps72Q62481 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vps72Q62481 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vps72Q62481 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vps72Q62481 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vps72Q62481 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vps72Q62481 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vps72Q62481 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Vps72Q62481 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Vps72Q62481 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Vps72Q62481 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Vps72Q62481 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Vps72Q62481 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vps72Q62481 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Vps72Q62481 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vps72Q62481 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vps72Q62481 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vps72Q62481 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vps72Q62481 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vps72Q62481 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Vps72Q62481 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vps72Q62481 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vps72Q62481 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vps72Q62481 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vps72Q62481 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vps72Q62481 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vps72Q62481 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vps72Q62481 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Vps72Q62481 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Vps72Q62481 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vps72Q62481 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vps72Q62481 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vps72Q62481 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vps72Q62481 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vps72Q62481 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Vps72Q62481 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Vps72Q62481 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Vps72Q62481 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vps72Q62481 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vps72Q62481 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vps72Q62481 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vps72Q62481 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vps72Q62481 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vps72Q62481 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vps72Q62481 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vps72Q62481 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Vps72Q62481 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vps72Q62481 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vps72Q62481 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vps72Q62481 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vps72Q62481 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vps72Q62481 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vps72Q62481 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Vps72Q62481 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vps72Q62481 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Vps72Q62481 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vps72Q62481 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vps72Q62481 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vps72Q62481 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vps72Q62481 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vps72Q62481 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vps72Q62481 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vps72Q62481 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vps72Q62481 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vps72Q62481 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vps72Q62481 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vps72Q62481 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vps72Q62481 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vps72Q62481 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vps72Q62481 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vps72Q62481 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vps72Q62481 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vps72Q62481 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vps72Q62481 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vps72Q62481 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vps72Q62481 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vps72Q62481 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Vps72Q62481 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Vps72Q62481 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Vps72Q62481 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vps72Q62481 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vps72Q62481 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Vps72Q62481 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vps72Q62481 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vps72Q62481 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps72Q62481 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps72Q62481 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps72Q62481 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps72Q62481 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms