Protein–RNA interactions for Protein: Q62440

Tle1, Transducin-like enhancer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tle1Q62440 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tle1Q62440 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tle1Q62440 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tle1Q62440 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tle1Q62440 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tle1Q62440 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tle1Q62440 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tle1Q62440 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tle1Q62440 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tle1Q62440 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tle1Q62440 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tle1Q62440 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tle1Q62440 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tle1Q62440 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tle1Q62440 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tle1Q62440 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tle1Q62440 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tle1Q62440 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tle1Q62440 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tle1Q62440 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tle1Q62440 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tle1Q62440 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tle1Q62440 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tle1Q62440 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tle1Q62440 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tle1Q62440 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tle1Q62440 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tle1Q62440 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tle1Q62440 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tle1Q62440 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tle1Q62440 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tle1Q62440 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tle1Q62440 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tle1Q62440 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tle1Q62440 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tle1Q62440 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tle1Q62440 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tle1Q62440 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tle1Q62440 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tle1Q62440 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tle1Q62440 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tle1Q62440 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tle1Q62440 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tle1Q62440 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tle1Q62440 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tle1Q62440 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tle1Q62440 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tle1Q62440 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tle1Q62440 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tle1Q62440 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tle1Q62440 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tle1Q62440 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tle1Q62440 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tle1Q62440 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tle1Q62440 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tle1Q62440 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tle1Q62440 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tle1Q62440 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tle1Q62440 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tle1Q62440 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tle1Q62440 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tle1Q62440 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tle1Q62440 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tle1Q62440 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tle1Q62440 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tle1Q62440 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tle1Q62440 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tle1Q62440 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tle1Q62440 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tle1Q62440 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tle1Q62440 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tle1Q62440 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tle1Q62440 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tle1Q62440 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tle1Q62440 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tle1Q62440 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tle1Q62440 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tle1Q62440 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tle1Q62440 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tle1Q62440 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tle1Q62440 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tle1Q62440 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tle1Q62440 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tle1Q62440 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tle1Q62440 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tle1Q62440 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tle1Q62440 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tle1Q62440 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tle1Q62440 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tle1Q62440 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tle1Q62440 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tle1Q62440 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tle1Q62440 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tle1Q62440 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tle1Q62440 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tle1Q62440 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tle1Q62440 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tle1Q62440 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tle1Q62440 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tle1Q62440 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms