Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Neurod1Q60867 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Neurod1Q60867 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Neurod1Q60867 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Neurod1Q60867 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Neurod1Q60867 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Neurod1Q60867 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Neurod1Q60867 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Neurod1Q60867 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Neurod1Q60867 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Neurod1Q60867 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Neurod1Q60867 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Neurod1Q60867 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Neurod1Q60867 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Neurod1Q60867 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Neurod1Q60867 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Neurod1Q60867 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Neurod1Q60867 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Neurod1Q60867 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Neurod1Q60867 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Neurod1Q60867 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Neurod1Q60867 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Neurod1Q60867 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Neurod1Q60867 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Neurod1Q60867 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Neurod1Q60867 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Neurod1Q60867 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Neurod1Q60867 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Neurod1Q60867 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
Neurod1Q60867 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Neurod1Q60867 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Neurod1Q60867 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Neurod1Q60867 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
Neurod1Q60867 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Neurod1Q60867 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Neurod1Q60867 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Neurod1Q60867 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Neurod1Q60867 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Neurod1Q60867 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Neurod1Q60867 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Neurod1Q60867 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Neurod1Q60867 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Neurod1Q60867 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Neurod1Q60867 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Neurod1Q60867 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Neurod1Q60867 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Neurod1Q60867 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Neurod1Q60867 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Neurod1Q60867 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Neurod1Q60867 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Neurod1Q60867 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Neurod1Q60867 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Neurod1Q60867 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Neurod1Q60867 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
Neurod1Q60867 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Neurod1Q60867 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Neurod1Q60867 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Neurod1Q60867 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Neurod1Q60867 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Neurod1Q60867 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Neurod1Q60867 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Neurod1Q60867 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Neurod1Q60867 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Neurod1Q60867 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Neurod1Q60867 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Neurod1Q60867 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Neurod1Q60867 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Neurod1Q60867 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Neurod1Q60867 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Neurod1Q60867 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Neurod1Q60867 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Neurod1Q60867 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Neurod1Q60867 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Neurod1Q60867 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Neurod1Q60867 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Neurod1Q60867 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Neurod1Q60867 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Neurod1Q60867 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Neurod1Q60867 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Neurod1Q60867 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Neurod1Q60867 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Neurod1Q60867 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Neurod1Q60867 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Neurod1Q60867 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Neurod1Q60867 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Neurod1Q60867 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Neurod1Q60867 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Neurod1Q60867 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Neurod1Q60867 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Neurod1Q60867 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Neurod1Q60867 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Neurod1Q60867 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Neurod1Q60867 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Neurod1Q60867 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Neurod1Q60867 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Neurod1Q60867 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Neurod1Q60867 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Neurod1Q60867 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Neurod1Q60867 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Neurod1Q60867 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.6 ms