Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SkiQ60698 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SkiQ60698 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SkiQ60698 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SkiQ60698 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SkiQ60698 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SkiQ60698 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SkiQ60698 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SkiQ60698 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SkiQ60698 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SkiQ60698 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SkiQ60698 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SkiQ60698 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SkiQ60698 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SkiQ60698 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SkiQ60698 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SkiQ60698 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SkiQ60698 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SkiQ60698 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SkiQ60698 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SkiQ60698 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SkiQ60698 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SkiQ60698 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SkiQ60698 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SkiQ60698 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SkiQ60698 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SkiQ60698 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SkiQ60698 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SkiQ60698 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SkiQ60698 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SkiQ60698 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SkiQ60698 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SkiQ60698 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SkiQ60698 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SkiQ60698 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SkiQ60698 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SkiQ60698 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SkiQ60698 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SkiQ60698 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SkiQ60698 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SkiQ60698 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SkiQ60698 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SkiQ60698 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SkiQ60698 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SkiQ60698 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SkiQ60698 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SkiQ60698 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SkiQ60698 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SkiQ60698 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SkiQ60698 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SkiQ60698 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SkiQ60698 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SkiQ60698 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SkiQ60698 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SkiQ60698 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SkiQ60698 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SkiQ60698 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SkiQ60698 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SkiQ60698 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SkiQ60698 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SkiQ60698 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SkiQ60698 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SkiQ60698 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SkiQ60698 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SkiQ60698 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SkiQ60698 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SkiQ60698 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SkiQ60698 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SkiQ60698 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SkiQ60698 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SkiQ60698 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SkiQ60698 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SkiQ60698 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SkiQ60698 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SkiQ60698 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SkiQ60698 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SkiQ60698 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SkiQ60698 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SkiQ60698 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SkiQ60698 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SkiQ60698 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SkiQ60698 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SkiQ60698 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SkiQ60698 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SkiQ60698 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SkiQ60698 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SkiQ60698 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SkiQ60698 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SkiQ60698 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SkiQ60698 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SkiQ60698 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SkiQ60698 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SkiQ60698 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SkiQ60698 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SkiQ60698 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SkiQ60698 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SkiQ60698 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SkiQ60698 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SkiQ60698 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SkiQ60698 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms