Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Foxd4Q60688 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Foxd4Q60688 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Foxd4Q60688 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Foxd4Q60688 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Foxd4Q60688 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Foxd4Q60688 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Foxd4Q60688 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Foxd4Q60688 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Foxd4Q60688 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Foxd4Q60688 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Foxd4Q60688 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Foxd4Q60688 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Foxd4Q60688 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Foxd4Q60688 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Foxd4Q60688 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Foxd4Q60688 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Foxd4Q60688 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Foxd4Q60688 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Foxd4Q60688 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Foxd4Q60688 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Foxd4Q60688 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Foxd4Q60688 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Foxd4Q60688 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Foxd4Q60688 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Foxd4Q60688 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Foxd4Q60688 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Foxd4Q60688 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Foxd4Q60688 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Foxd4Q60688 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Foxd4Q60688 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Foxd4Q60688 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Foxd4Q60688 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Foxd4Q60688 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Foxd4Q60688 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Foxd4Q60688 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Foxd4Q60688 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Foxd4Q60688 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Foxd4Q60688 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Foxd4Q60688 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Foxd4Q60688 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Foxd4Q60688 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Foxd4Q60688 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Foxd4Q60688 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Foxd4Q60688 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Foxd4Q60688 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Foxd4Q60688 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Foxd4Q60688 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Foxd4Q60688 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Foxd4Q60688 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Foxd4Q60688 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Foxd4Q60688 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Foxd4Q60688 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Foxd4Q60688 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Foxd4Q60688 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Foxd4Q60688 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Foxd4Q60688 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Foxd4Q60688 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Foxd4Q60688 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Foxd4Q60688 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Foxd4Q60688 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Foxd4Q60688 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Foxd4Q60688 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Foxd4Q60688 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Foxd4Q60688 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Foxd4Q60688 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Foxd4Q60688 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Foxd4Q60688 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Foxd4Q60688 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Foxd4Q60688 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Foxd4Q60688 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Foxd4Q60688 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Foxd4Q60688 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Foxd4Q60688 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Foxd4Q60688 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Foxd4Q60688 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Foxd4Q60688 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Foxd4Q60688 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Foxd4Q60688 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Foxd4Q60688 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Foxd4Q60688 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Foxd4Q60688 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Foxd4Q60688 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Foxd4Q60688 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Foxd4Q60688 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Foxd4Q60688 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Foxd4Q60688 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Foxd4Q60688 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Foxd4Q60688 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Foxd4Q60688 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Foxd4Q60688 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Foxd4Q60688 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Foxd4Q60688 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Foxd4Q60688 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Foxd4Q60688 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Foxd4Q60688 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Foxd4Q60688 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Foxd4Q60688 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Foxd4Q60688 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Foxd4Q60688 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms