Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
USPL1Q5W0Q7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
USPL1Q5W0Q7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
USPL1Q5W0Q7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
USPL1Q5W0Q7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
USPL1Q5W0Q7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
USPL1Q5W0Q7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
USPL1Q5W0Q7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
USPL1Q5W0Q7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC34.25■■■■□ 3.07
USPL1Q5W0Q7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
USPL1Q5W0Q7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
USPL1Q5W0Q7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
USPL1Q5W0Q7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
USPL1Q5W0Q7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
USPL1Q5W0Q7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
USPL1Q5W0Q7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
USPL1Q5W0Q7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
USPL1Q5W0Q7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
USPL1Q5W0Q7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
USPL1Q5W0Q7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
USPL1Q5W0Q7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
USPL1Q5W0Q7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
USPL1Q5W0Q7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
USPL1Q5W0Q7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
USPL1Q5W0Q7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
USPL1Q5W0Q7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
USPL1Q5W0Q7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
USPL1Q5W0Q7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
USPL1Q5W0Q7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
USPL1Q5W0Q7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
USPL1Q5W0Q7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
USPL1Q5W0Q7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
USPL1Q5W0Q7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
USPL1Q5W0Q7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
USPL1Q5W0Q7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
USPL1Q5W0Q7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
USPL1Q5W0Q7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
USPL1Q5W0Q7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
USPL1Q5W0Q7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
USPL1Q5W0Q7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
USPL1Q5W0Q7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
USPL1Q5W0Q7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
USPL1Q5W0Q7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
USPL1Q5W0Q7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
USPL1Q5W0Q7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
USPL1Q5W0Q7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
USPL1Q5W0Q7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
USPL1Q5W0Q7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
USPL1Q5W0Q7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
USPL1Q5W0Q7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
USPL1Q5W0Q7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
USPL1Q5W0Q7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
USPL1Q5W0Q7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
USPL1Q5W0Q7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
USPL1Q5W0Q7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
USPL1Q5W0Q7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
USPL1Q5W0Q7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
USPL1Q5W0Q7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
USPL1Q5W0Q7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
USPL1Q5W0Q7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
USPL1Q5W0Q7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
USPL1Q5W0Q7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
USPL1Q5W0Q7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
USPL1Q5W0Q7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
USPL1Q5W0Q7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
USPL1Q5W0Q7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
USPL1Q5W0Q7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
USPL1Q5W0Q7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
USPL1Q5W0Q7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
USPL1Q5W0Q7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
USPL1Q5W0Q7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
USPL1Q5W0Q7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
USPL1Q5W0Q7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
USPL1Q5W0Q7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
USPL1Q5W0Q7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
USPL1Q5W0Q7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
USPL1Q5W0Q7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
USPL1Q5W0Q7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
USPL1Q5W0Q7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
USPL1Q5W0Q7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
USPL1Q5W0Q7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
USPL1Q5W0Q7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
USPL1Q5W0Q7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
USPL1Q5W0Q7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
USPL1Q5W0Q7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
USPL1Q5W0Q7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
USPL1Q5W0Q7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
USPL1Q5W0Q7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
USPL1Q5W0Q7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
USPL1Q5W0Q7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
USPL1Q5W0Q7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
USPL1Q5W0Q7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
USPL1Q5W0Q7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
USPL1Q5W0Q7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
USPL1Q5W0Q7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
USPL1Q5W0Q7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
USPL1Q5W0Q7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
USPL1Q5W0Q7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
USPL1Q5W0Q7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
USPL1Q5W0Q7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms