Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B1

RNF219, RING finger protein 219, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF219Q5W0B1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF219Q5W0B1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF219Q5W0B1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF219Q5W0B1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF219Q5W0B1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF219Q5W0B1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF219Q5W0B1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF219Q5W0B1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RNF219Q5W0B1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RNF219Q5W0B1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF219Q5W0B1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF219Q5W0B1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF219Q5W0B1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF219Q5W0B1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF219Q5W0B1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF219Q5W0B1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF219Q5W0B1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF219Q5W0B1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF219Q5W0B1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF219Q5W0B1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF219Q5W0B1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF219Q5W0B1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF219Q5W0B1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF219Q5W0B1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF219Q5W0B1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF219Q5W0B1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF219Q5W0B1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF219Q5W0B1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF219Q5W0B1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF219Q5W0B1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF219Q5W0B1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF219Q5W0B1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF219Q5W0B1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF219Q5W0B1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF219Q5W0B1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF219Q5W0B1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF219Q5W0B1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF219Q5W0B1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF219Q5W0B1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF219Q5W0B1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RNF219Q5W0B1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RNF219Q5W0B1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RNF219Q5W0B1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF219Q5W0B1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF219Q5W0B1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF219Q5W0B1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF219Q5W0B1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF219Q5W0B1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF219Q5W0B1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF219Q5W0B1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF219Q5W0B1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF219Q5W0B1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF219Q5W0B1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF219Q5W0B1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF219Q5W0B1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF219Q5W0B1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF219Q5W0B1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF219Q5W0B1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF219Q5W0B1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RNF219Q5W0B1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF219Q5W0B1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF219Q5W0B1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF219Q5W0B1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF219Q5W0B1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF219Q5W0B1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF219Q5W0B1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF219Q5W0B1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF219Q5W0B1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF219Q5W0B1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF219Q5W0B1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF219Q5W0B1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF219Q5W0B1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF219Q5W0B1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF219Q5W0B1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF219Q5W0B1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF219Q5W0B1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF219Q5W0B1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF219Q5W0B1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF219Q5W0B1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF219Q5W0B1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF219Q5W0B1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF219Q5W0B1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF219Q5W0B1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF219Q5W0B1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF219Q5W0B1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF219Q5W0B1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF219Q5W0B1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF219Q5W0B1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF219Q5W0B1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF219Q5W0B1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF219Q5W0B1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF219Q5W0B1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF219Q5W0B1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RNF219Q5W0B1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF219Q5W0B1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF219Q5W0B1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF219Q5W0B1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF219Q5W0B1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF219Q5W0B1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF219Q5W0B1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms