Protein–RNA interactions for Protein: Q5W041

ARMC3, Armadillo repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARMC3Q5W041 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARMC3Q5W041 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ARMC3Q5W041 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARMC3Q5W041 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARMC3Q5W041 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARMC3Q5W041 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ARMC3Q5W041 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARMC3Q5W041 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARMC3Q5W041 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARMC3Q5W041 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARMC3Q5W041 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARMC3Q5W041 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARMC3Q5W041 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARMC3Q5W041 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARMC3Q5W041 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARMC3Q5W041 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARMC3Q5W041 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARMC3Q5W041 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARMC3Q5W041 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARMC3Q5W041 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARMC3Q5W041 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARMC3Q5W041 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARMC3Q5W041 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARMC3Q5W041 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARMC3Q5W041 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARMC3Q5W041 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARMC3Q5W041 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARMC3Q5W041 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARMC3Q5W041 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARMC3Q5W041 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARMC3Q5W041 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARMC3Q5W041 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARMC3Q5W041 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARMC3Q5W041 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARMC3Q5W041 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARMC3Q5W041 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARMC3Q5W041 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARMC3Q5W041 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARMC3Q5W041 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARMC3Q5W041 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARMC3Q5W041 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARMC3Q5W041 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARMC3Q5W041 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARMC3Q5W041 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARMC3Q5W041 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARMC3Q5W041 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARMC3Q5W041 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ARMC3Q5W041 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARMC3Q5W041 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARMC3Q5W041 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARMC3Q5W041 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARMC3Q5W041 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARMC3Q5W041 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARMC3Q5W041 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARMC3Q5W041 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ARMC3Q5W041 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARMC3Q5W041 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARMC3Q5W041 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARMC3Q5W041 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARMC3Q5W041 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARMC3Q5W041 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARMC3Q5W041 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARMC3Q5W041 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARMC3Q5W041 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARMC3Q5W041 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARMC3Q5W041 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARMC3Q5W041 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ARMC3Q5W041 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARMC3Q5W041 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARMC3Q5W041 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARMC3Q5W041 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARMC3Q5W041 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARMC3Q5W041 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARMC3Q5W041 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARMC3Q5W041 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARMC3Q5W041 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARMC3Q5W041 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARMC3Q5W041 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARMC3Q5W041 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARMC3Q5W041 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARMC3Q5W041 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARMC3Q5W041 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARMC3Q5W041 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ARMC3Q5W041 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARMC3Q5W041 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARMC3Q5W041 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARMC3Q5W041 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARMC3Q5W041 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARMC3Q5W041 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARMC3Q5W041 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ARMC3Q5W041 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARMC3Q5W041 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARMC3Q5W041 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARMC3Q5W041 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARMC3Q5W041 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ARMC3Q5W041 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ARMC3Q5W041 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ARMC3Q5W041 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARMC3Q5W041 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARMC3Q5W041 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms