Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF6Q5VXH4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF6Q5VXH4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF6Q5VXH4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF6Q5VXH4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF6Q5VXH4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF6Q5VXH4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF6Q5VXH4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF6Q5VXH4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF6Q5VXH4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF6Q5VXH4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF6Q5VXH4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF6Q5VXH4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF6Q5VXH4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF6Q5VXH4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF6Q5VXH4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF6Q5VXH4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF6Q5VXH4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF6Q5VXH4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF6Q5VXH4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF6Q5VXH4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF6Q5VXH4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF6Q5VXH4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF6Q5VXH4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF6Q5VXH4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF6Q5VXH4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF6Q5VXH4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF6Q5VXH4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF6Q5VXH4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF6Q5VXH4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF6Q5VXH4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF6Q5VXH4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF6Q5VXH4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF6Q5VXH4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF6Q5VXH4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF6Q5VXH4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF6Q5VXH4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF6Q5VXH4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF6Q5VXH4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF6Q5VXH4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF6Q5VXH4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRAMEF6Q5VXH4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF6Q5VXH4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF6Q5VXH4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF6Q5VXH4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF6Q5VXH4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF6Q5VXH4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF6Q5VXH4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF6Q5VXH4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF6Q5VXH4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF6Q5VXH4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF6Q5VXH4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF6Q5VXH4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF6Q5VXH4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF6Q5VXH4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF6Q5VXH4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF6Q5VXH4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF6Q5VXH4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF6Q5VXH4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF6Q5VXH4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF6Q5VXH4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF6Q5VXH4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF6Q5VXH4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF6Q5VXH4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF6Q5VXH4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF6Q5VXH4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF6Q5VXH4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF6Q5VXH4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF6Q5VXH4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF6Q5VXH4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF6Q5VXH4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
PRAMEF6Q5VXH4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF6Q5VXH4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF6Q5VXH4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF6Q5VXH4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF6Q5VXH4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF6Q5VXH4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF6Q5VXH4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF6Q5VXH4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF6Q5VXH4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF6Q5VXH4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF6Q5VXH4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF6Q5VXH4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF6Q5VXH4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF6Q5VXH4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF6Q5VXH4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF6Q5VXH4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF6Q5VXH4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF6Q5VXH4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF6Q5VXH4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF6Q5VXH4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF6Q5VXH4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF6Q5VXH4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF6Q5VXH4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF6Q5VXH4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF6Q5VXH4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF6Q5VXH4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF6Q5VXH4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms